Protein–RNA interactions for Protein: Q96A59

MARVELD3, MARVEL domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARVELD3Q96A59 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MARVELD3Q96A59 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MARVELD3Q96A59 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MARVELD3Q96A59 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
MARVELD3Q96A59 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MARVELD3Q96A59 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MARVELD3Q96A59 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MARVELD3Q96A59 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MARVELD3Q96A59 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MARVELD3Q96A59 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MARVELD3Q96A59 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MARVELD3Q96A59 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MARVELD3Q96A59 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MARVELD3Q96A59 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MARVELD3Q96A59 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MARVELD3Q96A59 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MARVELD3Q96A59 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MARVELD3Q96A59 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MARVELD3Q96A59 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MARVELD3Q96A59 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MARVELD3Q96A59 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MARVELD3Q96A59 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MARVELD3Q96A59 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MARVELD3Q96A59 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MARVELD3Q96A59 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MARVELD3Q96A59 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MARVELD3Q96A59 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MARVELD3Q96A59 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MARVELD3Q96A59 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MARVELD3Q96A59 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MARVELD3Q96A59 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MARVELD3Q96A59 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MARVELD3Q96A59 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MARVELD3Q96A59 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MARVELD3Q96A59 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MARVELD3Q96A59 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MARVELD3Q96A59 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MARVELD3Q96A59 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MARVELD3Q96A59 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MARVELD3Q96A59 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MARVELD3Q96A59 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MARVELD3Q96A59 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MARVELD3Q96A59 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MARVELD3Q96A59 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MARVELD3Q96A59 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MARVELD3Q96A59 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARVELD3Q96A59 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARVELD3Q96A59 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARVELD3Q96A59 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARVELD3Q96A59 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MARVELD3Q96A59 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MARVELD3Q96A59 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARVELD3Q96A59 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARVELD3Q96A59 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MARVELD3Q96A59 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MARVELD3Q96A59 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MARVELD3Q96A59 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MARVELD3Q96A59 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MARVELD3Q96A59 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MARVELD3Q96A59 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MARVELD3Q96A59 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MARVELD3Q96A59 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MARVELD3Q96A59 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MARVELD3Q96A59 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MARVELD3Q96A59 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MARVELD3Q96A59 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MARVELD3Q96A59 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MARVELD3Q96A59 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MARVELD3Q96A59 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MARVELD3Q96A59 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MARVELD3Q96A59 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MARVELD3Q96A59 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MARVELD3Q96A59 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MARVELD3Q96A59 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MARVELD3Q96A59 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MARVELD3Q96A59 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MARVELD3Q96A59 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MARVELD3Q96A59 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MARVELD3Q96A59 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MARVELD3Q96A59 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MARVELD3Q96A59 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MARVELD3Q96A59 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MARVELD3Q96A59 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MARVELD3Q96A59 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MARVELD3Q96A59 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MARVELD3Q96A59 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MARVELD3Q96A59 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MARVELD3Q96A59 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MARVELD3Q96A59 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MARVELD3Q96A59 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MARVELD3Q96A59 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MARVELD3Q96A59 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MARVELD3Q96A59 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MARVELD3Q96A59 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MARVELD3Q96A59 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MARVELD3Q96A59 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MARVELD3Q96A59 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MARVELD3Q96A59 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MARVELD3Q96A59 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MARVELD3Q96A59 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms