Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SPTSSAQ969W0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SPTSSAQ969W0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SPTSSAQ969W0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SPTSSAQ969W0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SPTSSAQ969W0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SPTSSAQ969W0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPTSSAQ969W0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPTSSAQ969W0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPTSSAQ969W0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPTSSAQ969W0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPTSSAQ969W0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPTSSAQ969W0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPTSSAQ969W0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPTSSAQ969W0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPTSSAQ969W0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPTSSAQ969W0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SPTSSAQ969W0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPTSSAQ969W0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPTSSAQ969W0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPTSSAQ969W0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPTSSAQ969W0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPTSSAQ969W0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPTSSAQ969W0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPTSSAQ969W0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPTSSAQ969W0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SPTSSAQ969W0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SPTSSAQ969W0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SPTSSAQ969W0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SPTSSAQ969W0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SPTSSAQ969W0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SPTSSAQ969W0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SPTSSAQ969W0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SPTSSAQ969W0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SPTSSAQ969W0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SPTSSAQ969W0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPTSSAQ969W0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPTSSAQ969W0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPTSSAQ969W0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SPTSSAQ969W0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPTSSAQ969W0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPTSSAQ969W0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPTSSAQ969W0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPTSSAQ969W0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPTSSAQ969W0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SPTSSAQ969W0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPTSSAQ969W0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPTSSAQ969W0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPTSSAQ969W0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPTSSAQ969W0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPTSSAQ969W0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPTSSAQ969W0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPTSSAQ969W0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPTSSAQ969W0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPTSSAQ969W0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPTSSAQ969W0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPTSSAQ969W0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPTSSAQ969W0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPTSSAQ969W0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPTSSAQ969W0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPTSSAQ969W0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SPTSSAQ969W0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPTSSAQ969W0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPTSSAQ969W0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPTSSAQ969W0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SPTSSAQ969W0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPTSSAQ969W0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SPTSSAQ969W0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SPTSSAQ969W0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPTSSAQ969W0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPTSSAQ969W0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPTSSAQ969W0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPTSSAQ969W0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPTSSAQ969W0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPTSSAQ969W0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPTSSAQ969W0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SPTSSAQ969W0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SPTSSAQ969W0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SPTSSAQ969W0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPTSSAQ969W0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPTSSAQ969W0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPTSSAQ969W0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPTSSAQ969W0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPTSSAQ969W0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPTSSAQ969W0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPTSSAQ969W0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPTSSAQ969W0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPTSSAQ969W0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPTSSAQ969W0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPTSSAQ969W0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPTSSAQ969W0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPTSSAQ969W0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPTSSAQ969W0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPTSSAQ969W0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPTSSAQ969W0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPTSSAQ969W0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPTSSAQ969W0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SPTSSAQ969W0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SPTSSAQ969W0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SPTSSAQ969W0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms