Protein–RNA interactions for Protein: Q969E4

TCEAL3, Transcription elongation factor A protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEAL3Q969E4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TCEAL3Q969E4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TCEAL3Q969E4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TCEAL3Q969E4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TCEAL3Q969E4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TCEAL3Q969E4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TCEAL3Q969E4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TCEAL3Q969E4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TCEAL3Q969E4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TCEAL3Q969E4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TCEAL3Q969E4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TCEAL3Q969E4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TCEAL3Q969E4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TCEAL3Q969E4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TCEAL3Q969E4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TCEAL3Q969E4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TCEAL3Q969E4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TCEAL3Q969E4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TCEAL3Q969E4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TCEAL3Q969E4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TCEAL3Q969E4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TCEAL3Q969E4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TCEAL3Q969E4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TCEAL3Q969E4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TCEAL3Q969E4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCEAL3Q969E4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCEAL3Q969E4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCEAL3Q969E4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCEAL3Q969E4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCEAL3Q969E4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCEAL3Q969E4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCEAL3Q969E4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCEAL3Q969E4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCEAL3Q969E4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCEAL3Q969E4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCEAL3Q969E4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCEAL3Q969E4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCEAL3Q969E4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TCEAL3Q969E4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TCEAL3Q969E4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TCEAL3Q969E4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TCEAL3Q969E4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TCEAL3Q969E4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TCEAL3Q969E4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TCEAL3Q969E4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TCEAL3Q969E4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TCEAL3Q969E4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TCEAL3Q969E4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TCEAL3Q969E4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TCEAL3Q969E4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TCEAL3Q969E4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TCEAL3Q969E4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TCEAL3Q969E4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TCEAL3Q969E4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TCEAL3Q969E4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TCEAL3Q969E4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TCEAL3Q969E4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TCEAL3Q969E4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCEAL3Q969E4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCEAL3Q969E4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCEAL3Q969E4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCEAL3Q969E4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCEAL3Q969E4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCEAL3Q969E4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCEAL3Q969E4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCEAL3Q969E4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TCEAL3Q969E4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TCEAL3Q969E4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TCEAL3Q969E4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TCEAL3Q969E4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TCEAL3Q969E4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TCEAL3Q969E4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TCEAL3Q969E4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TCEAL3Q969E4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TCEAL3Q969E4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCEAL3Q969E4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCEAL3Q969E4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCEAL3Q969E4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCEAL3Q969E4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCEAL3Q969E4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCEAL3Q969E4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCEAL3Q969E4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCEAL3Q969E4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCEAL3Q969E4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCEAL3Q969E4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCEAL3Q969E4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCEAL3Q969E4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCEAL3Q969E4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCEAL3Q969E4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCEAL3Q969E4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TCEAL3Q969E4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCEAL3Q969E4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCEAL3Q969E4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCEAL3Q969E4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCEAL3Q969E4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCEAL3Q969E4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCEAL3Q969E4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCEAL3Q969E4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCEAL3Q969E4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCEAL3Q969E4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms