Protein–RNA interactions for Protein: Q92973

TNPO1, Transportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO1Q92973 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TNPO1Q92973 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TNPO1Q92973 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TNPO1Q92973 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TNPO1Q92973 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TNPO1Q92973 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TNPO1Q92973 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TNPO1Q92973 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TNPO1Q92973 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TNPO1Q92973 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
TNPO1Q92973 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TNPO1Q92973 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TNPO1Q92973 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TNPO1Q92973 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TNPO1Q92973 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNPO1Q92973 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNPO1Q92973 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNPO1Q92973 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNPO1Q92973 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNPO1Q92973 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNPO1Q92973 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNPO1Q92973 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TNPO1Q92973 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TNPO1Q92973 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TNPO1Q92973 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TNPO1Q92973 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TNPO1Q92973 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TNPO1Q92973 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TNPO1Q92973 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TNPO1Q92973 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TNPO1Q92973 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TNPO1Q92973 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TNPO1Q92973 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TNPO1Q92973 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TNPO1Q92973 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
TNPO1Q92973 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TNPO1Q92973 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TNPO1Q92973 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TNPO1Q92973 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TNPO1Q92973 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TNPO1Q92973 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TNPO1Q92973 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TNPO1Q92973 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TNPO1Q92973 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
TNPO1Q92973 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TNPO1Q92973 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TNPO1Q92973 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TNPO1Q92973 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TNPO1Q92973 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TNPO1Q92973 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TNPO1Q92973 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TNPO1Q92973 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TNPO1Q92973 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TNPO1Q92973 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TNPO1Q92973 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TNPO1Q92973 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TNPO1Q92973 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TNPO1Q92973 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TNPO1Q92973 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TNPO1Q92973 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TNPO1Q92973 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TNPO1Q92973 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TNPO1Q92973 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TNPO1Q92973 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TNPO1Q92973 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TNPO1Q92973 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TNPO1Q92973 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TNPO1Q92973 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
TNPO1Q92973 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
TNPO1Q92973 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TNPO1Q92973 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TNPO1Q92973 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TNPO1Q92973 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TNPO1Q92973 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TNPO1Q92973 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TNPO1Q92973 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TNPO1Q92973 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TNPO1Q92973 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TNPO1Q92973 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TNPO1Q92973 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TNPO1Q92973 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TNPO1Q92973 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TNPO1Q92973 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
TNPO1Q92973 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TNPO1Q92973 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TNPO1Q92973 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TNPO1Q92973 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TNPO1Q92973 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TNPO1Q92973 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TNPO1Q92973 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TNPO1Q92973 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TNPO1Q92973 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TNPO1Q92973 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TNPO1Q92973 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TNPO1Q92973 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TNPO1Q92973 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TNPO1Q92973 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TNPO1Q92973 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TNPO1Q92973 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TNPO1Q92973 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms