Protein–RNA interactions for Protein: Q92544

TM9SF4, Transmembrane 9 superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM9SF4Q92544 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TM9SF4Q92544 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TM9SF4Q92544 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TM9SF4Q92544 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TM9SF4Q92544 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TM9SF4Q92544 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TM9SF4Q92544 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TM9SF4Q92544 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TM9SF4Q92544 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TM9SF4Q92544 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TM9SF4Q92544 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TM9SF4Q92544 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TM9SF4Q92544 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TM9SF4Q92544 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TM9SF4Q92544 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TM9SF4Q92544 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TM9SF4Q92544 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TM9SF4Q92544 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TM9SF4Q92544 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TM9SF4Q92544 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TM9SF4Q92544 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TM9SF4Q92544 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TM9SF4Q92544 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TM9SF4Q92544 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TM9SF4Q92544 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TM9SF4Q92544 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TM9SF4Q92544 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TM9SF4Q92544 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TM9SF4Q92544 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TM9SF4Q92544 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TM9SF4Q92544 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TM9SF4Q92544 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TM9SF4Q92544 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TM9SF4Q92544 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TM9SF4Q92544 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TM9SF4Q92544 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TM9SF4Q92544 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TM9SF4Q92544 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TM9SF4Q92544 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TM9SF4Q92544 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TM9SF4Q92544 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TM9SF4Q92544 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TM9SF4Q92544 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TM9SF4Q92544 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TM9SF4Q92544 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TM9SF4Q92544 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TM9SF4Q92544 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TM9SF4Q92544 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TM9SF4Q92544 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TM9SF4Q92544 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TM9SF4Q92544 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TM9SF4Q92544 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TM9SF4Q92544 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TM9SF4Q92544 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TM9SF4Q92544 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TM9SF4Q92544 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TM9SF4Q92544 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TM9SF4Q92544 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TM9SF4Q92544 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TM9SF4Q92544 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TM9SF4Q92544 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TM9SF4Q92544 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TM9SF4Q92544 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TM9SF4Q92544 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TM9SF4Q92544 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TM9SF4Q92544 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TM9SF4Q92544 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TM9SF4Q92544 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TM9SF4Q92544 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TM9SF4Q92544 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TM9SF4Q92544 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TM9SF4Q92544 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TM9SF4Q92544 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TM9SF4Q92544 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TM9SF4Q92544 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TM9SF4Q92544 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TM9SF4Q92544 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TM9SF4Q92544 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TM9SF4Q92544 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TM9SF4Q92544 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TM9SF4Q92544 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TM9SF4Q92544 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TM9SF4Q92544 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TM9SF4Q92544 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TM9SF4Q92544 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TM9SF4Q92544 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TM9SF4Q92544 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TM9SF4Q92544 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TM9SF4Q92544 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TM9SF4Q92544 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TM9SF4Q92544 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TM9SF4Q92544 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TM9SF4Q92544 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TM9SF4Q92544 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TM9SF4Q92544 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TM9SF4Q92544 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TM9SF4Q92544 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TM9SF4Q92544 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TM9SF4Q92544 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TM9SF4Q92544 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms