Protein–RNA interactions for Protein: Q92530

PSMF1, Proteasome inhibitor PI31 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMF1Q92530 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMF1Q92530 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMF1Q92530 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMF1Q92530 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMF1Q92530 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMF1Q92530 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMF1Q92530 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMF1Q92530 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMF1Q92530 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMF1Q92530 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMF1Q92530 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMF1Q92530 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMF1Q92530 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMF1Q92530 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMF1Q92530 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMF1Q92530 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMF1Q92530 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMF1Q92530 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMF1Q92530 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMF1Q92530 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMF1Q92530 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMF1Q92530 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMF1Q92530 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMF1Q92530 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMF1Q92530 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMF1Q92530 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMF1Q92530 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMF1Q92530 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMF1Q92530 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMF1Q92530 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMF1Q92530 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMF1Q92530 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PSMF1Q92530 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PSMF1Q92530 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMF1Q92530 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMF1Q92530 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMF1Q92530 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMF1Q92530 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMF1Q92530 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMF1Q92530 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMF1Q92530 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMF1Q92530 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMF1Q92530 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMF1Q92530 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMF1Q92530 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMF1Q92530 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMF1Q92530 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMF1Q92530 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMF1Q92530 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMF1Q92530 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMF1Q92530 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMF1Q92530 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMF1Q92530 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMF1Q92530 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMF1Q92530 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMF1Q92530 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMF1Q92530 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMF1Q92530 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMF1Q92530 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMF1Q92530 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMF1Q92530 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMF1Q92530 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMF1Q92530 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMF1Q92530 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMF1Q92530 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMF1Q92530 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMF1Q92530 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PSMF1Q92530 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMF1Q92530 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMF1Q92530 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMF1Q92530 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMF1Q92530 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMF1Q92530 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMF1Q92530 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMF1Q92530 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMF1Q92530 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMF1Q92530 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMF1Q92530 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PSMF1Q92530 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PSMF1Q92530 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMF1Q92530 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PSMF1Q92530 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMF1Q92530 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PSMF1Q92530 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMF1Q92530 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMF1Q92530 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMF1Q92530 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMF1Q92530 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMF1Q92530 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMF1Q92530 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMF1Q92530 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMF1Q92530 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMF1Q92530 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMF1Q92530 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMF1Q92530 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMF1Q92530 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMF1Q92530 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMF1Q92530 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMF1Q92530 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMF1Q92530 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms