Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVY7

UBLCP1, Ubiquitin-like domain-containing CTD phosphatase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBLCP1Q8WVY7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBLCP1Q8WVY7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBLCP1Q8WVY7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBLCP1Q8WVY7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBLCP1Q8WVY7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBLCP1Q8WVY7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBLCP1Q8WVY7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBLCP1Q8WVY7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBLCP1Q8WVY7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBLCP1Q8WVY7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBLCP1Q8WVY7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBLCP1Q8WVY7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBLCP1Q8WVY7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBLCP1Q8WVY7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBLCP1Q8WVY7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBLCP1Q8WVY7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBLCP1Q8WVY7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
UBLCP1Q8WVY7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBLCP1Q8WVY7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBLCP1Q8WVY7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBLCP1Q8WVY7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBLCP1Q8WVY7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBLCP1Q8WVY7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBLCP1Q8WVY7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBLCP1Q8WVY7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBLCP1Q8WVY7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBLCP1Q8WVY7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBLCP1Q8WVY7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBLCP1Q8WVY7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBLCP1Q8WVY7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBLCP1Q8WVY7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBLCP1Q8WVY7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBLCP1Q8WVY7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBLCP1Q8WVY7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBLCP1Q8WVY7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBLCP1Q8WVY7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBLCP1Q8WVY7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBLCP1Q8WVY7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBLCP1Q8WVY7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBLCP1Q8WVY7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBLCP1Q8WVY7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBLCP1Q8WVY7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBLCP1Q8WVY7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBLCP1Q8WVY7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBLCP1Q8WVY7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBLCP1Q8WVY7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBLCP1Q8WVY7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBLCP1Q8WVY7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBLCP1Q8WVY7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBLCP1Q8WVY7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBLCP1Q8WVY7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
UBLCP1Q8WVY7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBLCP1Q8WVY7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
UBLCP1Q8WVY7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBLCP1Q8WVY7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBLCP1Q8WVY7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBLCP1Q8WVY7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBLCP1Q8WVY7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBLCP1Q8WVY7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBLCP1Q8WVY7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBLCP1Q8WVY7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBLCP1Q8WVY7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBLCP1Q8WVY7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBLCP1Q8WVY7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
UBLCP1Q8WVY7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBLCP1Q8WVY7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
UBLCP1Q8WVY7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
UBLCP1Q8WVY7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBLCP1Q8WVY7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBLCP1Q8WVY7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBLCP1Q8WVY7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBLCP1Q8WVY7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBLCP1Q8WVY7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBLCP1Q8WVY7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBLCP1Q8WVY7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBLCP1Q8WVY7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBLCP1Q8WVY7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBLCP1Q8WVY7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
UBLCP1Q8WVY7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBLCP1Q8WVY7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBLCP1Q8WVY7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBLCP1Q8WVY7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBLCP1Q8WVY7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBLCP1Q8WVY7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBLCP1Q8WVY7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBLCP1Q8WVY7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBLCP1Q8WVY7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBLCP1Q8WVY7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBLCP1Q8WVY7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBLCP1Q8WVY7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBLCP1Q8WVY7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBLCP1Q8WVY7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBLCP1Q8WVY7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBLCP1Q8WVY7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBLCP1Q8WVY7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
UBLCP1Q8WVY7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBLCP1Q8WVY7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBLCP1Q8WVY7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBLCP1Q8WVY7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBLCP1Q8WVY7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms