Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVF5

KCTD4, BTB/POZ domain-containing protein KCTD4, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD4Q8WVF5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
KCTD4Q8WVF5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCTD4Q8WVF5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCTD4Q8WVF5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCTD4Q8WVF5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCTD4Q8WVF5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCTD4Q8WVF5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCTD4Q8WVF5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCTD4Q8WVF5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCTD4Q8WVF5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCTD4Q8WVF5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCTD4Q8WVF5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCTD4Q8WVF5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCTD4Q8WVF5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCTD4Q8WVF5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCTD4Q8WVF5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCTD4Q8WVF5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCTD4Q8WVF5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCTD4Q8WVF5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCTD4Q8WVF5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCTD4Q8WVF5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
KCTD4Q8WVF5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCTD4Q8WVF5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCTD4Q8WVF5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCTD4Q8WVF5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCTD4Q8WVF5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCTD4Q8WVF5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCTD4Q8WVF5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCTD4Q8WVF5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCTD4Q8WVF5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCTD4Q8WVF5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCTD4Q8WVF5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCTD4Q8WVF5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCTD4Q8WVF5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCTD4Q8WVF5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
KCTD4Q8WVF5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCTD4Q8WVF5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCTD4Q8WVF5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCTD4Q8WVF5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCTD4Q8WVF5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCTD4Q8WVF5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCTD4Q8WVF5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCTD4Q8WVF5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCTD4Q8WVF5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCTD4Q8WVF5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCTD4Q8WVF5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCTD4Q8WVF5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCTD4Q8WVF5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCTD4Q8WVF5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCTD4Q8WVF5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCTD4Q8WVF5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCTD4Q8WVF5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCTD4Q8WVF5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCTD4Q8WVF5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCTD4Q8WVF5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
KCTD4Q8WVF5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCTD4Q8WVF5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCTD4Q8WVF5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
KCTD4Q8WVF5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCTD4Q8WVF5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCTD4Q8WVF5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCTD4Q8WVF5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCTD4Q8WVF5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
KCTD4Q8WVF5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
KCTD4Q8WVF5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCTD4Q8WVF5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCTD4Q8WVF5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCTD4Q8WVF5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCTD4Q8WVF5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCTD4Q8WVF5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCTD4Q8WVF5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCTD4Q8WVF5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCTD4Q8WVF5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCTD4Q8WVF5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCTD4Q8WVF5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCTD4Q8WVF5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCTD4Q8WVF5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCTD4Q8WVF5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCTD4Q8WVF5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCTD4Q8WVF5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCTD4Q8WVF5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCTD4Q8WVF5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCTD4Q8WVF5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCTD4Q8WVF5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KCTD4Q8WVF5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCTD4Q8WVF5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCTD4Q8WVF5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCTD4Q8WVF5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCTD4Q8WVF5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCTD4Q8WVF5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCTD4Q8WVF5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCTD4Q8WVF5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCTD4Q8WVF5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCTD4Q8WVF5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCTD4Q8WVF5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCTD4Q8WVF5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCTD4Q8WVF5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KCTD4Q8WVF5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCTD4Q8WVF5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCTD4Q8WVF5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms