Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV35

LRRC29, Leucine-rich repeat-containing protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC29Q8WV35 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRRC29Q8WV35 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRRC29Q8WV35 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRRC29Q8WV35 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRRC29Q8WV35 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRRC29Q8WV35 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LRRC29Q8WV35 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRRC29Q8WV35 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRRC29Q8WV35 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRRC29Q8WV35 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRRC29Q8WV35 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRRC29Q8WV35 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRRC29Q8WV35 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LRRC29Q8WV35 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRRC29Q8WV35 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LRRC29Q8WV35 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRRC29Q8WV35 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRRC29Q8WV35 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRRC29Q8WV35 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRRC29Q8WV35 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LRRC29Q8WV35 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LRRC29Q8WV35 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRRC29Q8WV35 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRRC29Q8WV35 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRRC29Q8WV35 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRRC29Q8WV35 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRRC29Q8WV35 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRRC29Q8WV35 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LRRC29Q8WV35 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRRC29Q8WV35 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRRC29Q8WV35 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRRC29Q8WV35 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRRC29Q8WV35 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRRC29Q8WV35 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRRC29Q8WV35 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRRC29Q8WV35 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LRRC29Q8WV35 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRC29Q8WV35 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRC29Q8WV35 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRC29Q8WV35 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRC29Q8WV35 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRC29Q8WV35 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRC29Q8WV35 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRC29Q8WV35 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRC29Q8WV35 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRC29Q8WV35 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRC29Q8WV35 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRC29Q8WV35 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRC29Q8WV35 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRC29Q8WV35 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRC29Q8WV35 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRC29Q8WV35 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRC29Q8WV35 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRC29Q8WV35 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRC29Q8WV35 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC29Q8WV35 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC29Q8WV35 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC29Q8WV35 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC29Q8WV35 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC29Q8WV35 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC29Q8WV35 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC29Q8WV35 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC29Q8WV35 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC29Q8WV35 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC29Q8WV35 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRC29Q8WV35 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRC29Q8WV35 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRC29Q8WV35 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRC29Q8WV35 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRC29Q8WV35 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRC29Q8WV35 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRC29Q8WV35 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRC29Q8WV35 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRC29Q8WV35 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRC29Q8WV35 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRC29Q8WV35 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRC29Q8WV35 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRC29Q8WV35 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRC29Q8WV35 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRC29Q8WV35 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRRC29Q8WV35 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRRC29Q8WV35 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRRC29Q8WV35 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRRC29Q8WV35 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
LRRC29Q8WV35 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRRC29Q8WV35 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LRRC29Q8WV35 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LRRC29Q8WV35 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LRRC29Q8WV35 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRC29Q8WV35 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRC29Q8WV35 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRC29Q8WV35 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRC29Q8WV35 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRC29Q8WV35 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRC29Q8WV35 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRC29Q8WV35 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRC29Q8WV35 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRC29Q8WV35 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRC29Q8WV35 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRC29Q8WV35 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms