Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDR0

TRAF3IP1, TRAF3-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP1Q8TDR0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAF3IP1Q8TDR0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAF3IP1Q8TDR0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAF3IP1Q8TDR0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAF3IP1Q8TDR0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAF3IP1Q8TDR0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAF3IP1Q8TDR0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAF3IP1Q8TDR0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAF3IP1Q8TDR0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAF3IP1Q8TDR0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAF3IP1Q8TDR0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAF3IP1Q8TDR0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAF3IP1Q8TDR0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAF3IP1Q8TDR0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAF3IP1Q8TDR0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAF3IP1Q8TDR0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAF3IP1Q8TDR0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAF3IP1Q8TDR0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAF3IP1Q8TDR0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAF3IP1Q8TDR0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAF3IP1Q8TDR0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAF3IP1Q8TDR0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAF3IP1Q8TDR0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAF3IP1Q8TDR0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAF3IP1Q8TDR0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAF3IP1Q8TDR0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAF3IP1Q8TDR0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAF3IP1Q8TDR0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAF3IP1Q8TDR0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAF3IP1Q8TDR0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAF3IP1Q8TDR0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAF3IP1Q8TDR0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAF3IP1Q8TDR0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAF3IP1Q8TDR0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAF3IP1Q8TDR0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAF3IP1Q8TDR0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAF3IP1Q8TDR0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAF3IP1Q8TDR0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAF3IP1Q8TDR0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAF3IP1Q8TDR0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAF3IP1Q8TDR0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAF3IP1Q8TDR0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAF3IP1Q8TDR0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAF3IP1Q8TDR0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAF3IP1Q8TDR0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAF3IP1Q8TDR0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAF3IP1Q8TDR0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAF3IP1Q8TDR0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAF3IP1Q8TDR0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAF3IP1Q8TDR0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAF3IP1Q8TDR0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAF3IP1Q8TDR0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAF3IP1Q8TDR0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAF3IP1Q8TDR0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAF3IP1Q8TDR0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAF3IP1Q8TDR0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAF3IP1Q8TDR0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAF3IP1Q8TDR0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAF3IP1Q8TDR0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAF3IP1Q8TDR0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAF3IP1Q8TDR0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAF3IP1Q8TDR0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAF3IP1Q8TDR0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAF3IP1Q8TDR0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAF3IP1Q8TDR0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAF3IP1Q8TDR0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAF3IP1Q8TDR0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAF3IP1Q8TDR0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAF3IP1Q8TDR0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAF3IP1Q8TDR0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAF3IP1Q8TDR0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAF3IP1Q8TDR0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAF3IP1Q8TDR0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAF3IP1Q8TDR0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAF3IP1Q8TDR0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAF3IP1Q8TDR0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAF3IP1Q8TDR0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAF3IP1Q8TDR0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAF3IP1Q8TDR0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAF3IP1Q8TDR0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAF3IP1Q8TDR0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAF3IP1Q8TDR0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAF3IP1Q8TDR0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAF3IP1Q8TDR0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAF3IP1Q8TDR0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAF3IP1Q8TDR0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAF3IP1Q8TDR0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAF3IP1Q8TDR0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAF3IP1Q8TDR0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAF3IP1Q8TDR0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAF3IP1Q8TDR0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAF3IP1Q8TDR0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAF3IP1Q8TDR0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAF3IP1Q8TDR0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAF3IP1Q8TDR0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAF3IP1Q8TDR0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAF3IP1Q8TDR0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAF3IP1Q8TDR0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAF3IP1Q8TDR0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAF3IP1Q8TDR0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms