Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDC3

BRSK1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK1Q8TDC3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
BRSK1Q8TDC3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRSK1Q8TDC3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRSK1Q8TDC3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRSK1Q8TDC3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRSK1Q8TDC3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
BRSK1Q8TDC3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRSK1Q8TDC3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRSK1Q8TDC3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRSK1Q8TDC3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRSK1Q8TDC3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRSK1Q8TDC3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRSK1Q8TDC3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
BRSK1Q8TDC3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRSK1Q8TDC3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRSK1Q8TDC3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRSK1Q8TDC3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRSK1Q8TDC3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRSK1Q8TDC3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRSK1Q8TDC3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRSK1Q8TDC3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRSK1Q8TDC3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRSK1Q8TDC3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRSK1Q8TDC3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
BRSK1Q8TDC3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRSK1Q8TDC3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRSK1Q8TDC3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRSK1Q8TDC3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRSK1Q8TDC3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRSK1Q8TDC3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRSK1Q8TDC3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRSK1Q8TDC3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
BRSK1Q8TDC3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRSK1Q8TDC3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
BRSK1Q8TDC3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRSK1Q8TDC3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRSK1Q8TDC3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRSK1Q8TDC3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRSK1Q8TDC3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRSK1Q8TDC3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRSK1Q8TDC3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRSK1Q8TDC3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRSK1Q8TDC3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRSK1Q8TDC3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRSK1Q8TDC3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRSK1Q8TDC3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRSK1Q8TDC3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRSK1Q8TDC3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRSK1Q8TDC3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRSK1Q8TDC3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRSK1Q8TDC3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRSK1Q8TDC3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRSK1Q8TDC3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRSK1Q8TDC3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRSK1Q8TDC3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRSK1Q8TDC3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRSK1Q8TDC3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
BRSK1Q8TDC3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRSK1Q8TDC3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
BRSK1Q8TDC3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
BRSK1Q8TDC3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
BRSK1Q8TDC3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
BRSK1Q8TDC3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BRSK1Q8TDC3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BRSK1Q8TDC3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
BRSK1Q8TDC3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BRSK1Q8TDC3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BRSK1Q8TDC3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BRSK1Q8TDC3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BRSK1Q8TDC3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BRSK1Q8TDC3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BRSK1Q8TDC3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRSK1Q8TDC3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRSK1Q8TDC3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRSK1Q8TDC3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
BRSK1Q8TDC3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRSK1Q8TDC3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRSK1Q8TDC3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRSK1Q8TDC3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRSK1Q8TDC3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRSK1Q8TDC3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRSK1Q8TDC3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRSK1Q8TDC3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRSK1Q8TDC3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRSK1Q8TDC3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRSK1Q8TDC3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRSK1Q8TDC3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRSK1Q8TDC3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRSK1Q8TDC3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
BRSK1Q8TDC3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRSK1Q8TDC3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRSK1Q8TDC3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRSK1Q8TDC3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRSK1Q8TDC3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRSK1Q8TDC3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRSK1Q8TDC3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRSK1Q8TDC3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRSK1Q8TDC3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRSK1Q8TDC3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRSK1Q8TDC3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms