Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD17

ZNF398, Zinc finger protein 398, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF398Q8TD17 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF398Q8TD17 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF398Q8TD17 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF398Q8TD17 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF398Q8TD17 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF398Q8TD17 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF398Q8TD17 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF398Q8TD17 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF398Q8TD17 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF398Q8TD17 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF398Q8TD17 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZNF398Q8TD17 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF398Q8TD17 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF398Q8TD17 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF398Q8TD17 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF398Q8TD17 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF398Q8TD17 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF398Q8TD17 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF398Q8TD17 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF398Q8TD17 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF398Q8TD17 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF398Q8TD17 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF398Q8TD17 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF398Q8TD17 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF398Q8TD17 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF398Q8TD17 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF398Q8TD17 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF398Q8TD17 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF398Q8TD17 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF398Q8TD17 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF398Q8TD17 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF398Q8TD17 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF398Q8TD17 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF398Q8TD17 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF398Q8TD17 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF398Q8TD17 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF398Q8TD17 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF398Q8TD17 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF398Q8TD17 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF398Q8TD17 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF398Q8TD17 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF398Q8TD17 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF398Q8TD17 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF398Q8TD17 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF398Q8TD17 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF398Q8TD17 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF398Q8TD17 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF398Q8TD17 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF398Q8TD17 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF398Q8TD17 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF398Q8TD17 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF398Q8TD17 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF398Q8TD17 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF398Q8TD17 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF398Q8TD17 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF398Q8TD17 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF398Q8TD17 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF398Q8TD17 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF398Q8TD17 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF398Q8TD17 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF398Q8TD17 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF398Q8TD17 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF398Q8TD17 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF398Q8TD17 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF398Q8TD17 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF398Q8TD17 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF398Q8TD17 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF398Q8TD17 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF398Q8TD17 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF398Q8TD17 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF398Q8TD17 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF398Q8TD17 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF398Q8TD17 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF398Q8TD17 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF398Q8TD17 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF398Q8TD17 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF398Q8TD17 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF398Q8TD17 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF398Q8TD17 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF398Q8TD17 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF398Q8TD17 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF398Q8TD17 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF398Q8TD17 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF398Q8TD17 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZNF398Q8TD17 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
ZNF398Q8TD17 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF398Q8TD17 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF398Q8TD17 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF398Q8TD17 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF398Q8TD17 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF398Q8TD17 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF398Q8TD17 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF398Q8TD17 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF398Q8TD17 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF398Q8TD17 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF398Q8TD17 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF398Q8TD17 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF398Q8TD17 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF398Q8TD17 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF398Q8TD17 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms