Protein–RNA interactions for Protein: Q8TA86

RP9, Retinitis pigmentosa 9 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RP9Q8TA86 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RP9Q8TA86 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RP9Q8TA86 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RP9Q8TA86 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RP9Q8TA86 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RP9Q8TA86 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RP9Q8TA86 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RP9Q8TA86 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RP9Q8TA86 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RP9Q8TA86 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RP9Q8TA86 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RP9Q8TA86 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RP9Q8TA86 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RP9Q8TA86 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RP9Q8TA86 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RP9Q8TA86 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RP9Q8TA86 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RP9Q8TA86 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RP9Q8TA86 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RP9Q8TA86 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RP9Q8TA86 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RP9Q8TA86 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RP9Q8TA86 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RP9Q8TA86 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RP9Q8TA86 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RP9Q8TA86 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RP9Q8TA86 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RP9Q8TA86 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RP9Q8TA86 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RP9Q8TA86 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RP9Q8TA86 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RP9Q8TA86 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RP9Q8TA86 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RP9Q8TA86 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RP9Q8TA86 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RP9Q8TA86 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RP9Q8TA86 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RP9Q8TA86 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RP9Q8TA86 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RP9Q8TA86 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RP9Q8TA86 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RP9Q8TA86 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RP9Q8TA86 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RP9Q8TA86 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RP9Q8TA86 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RP9Q8TA86 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RP9Q8TA86 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RP9Q8TA86 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RP9Q8TA86 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RP9Q8TA86 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RP9Q8TA86 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RP9Q8TA86 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RP9Q8TA86 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RP9Q8TA86 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RP9Q8TA86 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RP9Q8TA86 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RP9Q8TA86 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RP9Q8TA86 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RP9Q8TA86 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RP9Q8TA86 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RP9Q8TA86 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RP9Q8TA86 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RP9Q8TA86 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RP9Q8TA86 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RP9Q8TA86 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RP9Q8TA86 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RP9Q8TA86 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RP9Q8TA86 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RP9Q8TA86 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RP9Q8TA86 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RP9Q8TA86 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RP9Q8TA86 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RP9Q8TA86 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RP9Q8TA86 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RP9Q8TA86 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RP9Q8TA86 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RP9Q8TA86 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RP9Q8TA86 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RP9Q8TA86 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RP9Q8TA86 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RP9Q8TA86 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RP9Q8TA86 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RP9Q8TA86 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RP9Q8TA86 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RP9Q8TA86 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RP9Q8TA86 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RP9Q8TA86 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RP9Q8TA86 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RP9Q8TA86 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RP9Q8TA86 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RP9Q8TA86 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RP9Q8TA86 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RP9Q8TA86 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RP9Q8TA86 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RP9Q8TA86 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RP9Q8TA86 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RP9Q8TA86 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RP9Q8TA86 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RP9Q8TA86 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RP9Q8TA86 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms