Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHS4

CLHC1, Clathrin heavy chain linker domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLHC1Q8NHS4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLHC1Q8NHS4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLHC1Q8NHS4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLHC1Q8NHS4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLHC1Q8NHS4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLHC1Q8NHS4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLHC1Q8NHS4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLHC1Q8NHS4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLHC1Q8NHS4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLHC1Q8NHS4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLHC1Q8NHS4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLHC1Q8NHS4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CLHC1Q8NHS4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLHC1Q8NHS4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLHC1Q8NHS4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CLHC1Q8NHS4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLHC1Q8NHS4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLHC1Q8NHS4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLHC1Q8NHS4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLHC1Q8NHS4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLHC1Q8NHS4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CLHC1Q8NHS4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLHC1Q8NHS4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLHC1Q8NHS4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLHC1Q8NHS4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLHC1Q8NHS4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLHC1Q8NHS4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLHC1Q8NHS4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLHC1Q8NHS4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLHC1Q8NHS4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLHC1Q8NHS4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLHC1Q8NHS4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLHC1Q8NHS4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLHC1Q8NHS4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CLHC1Q8NHS4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CLHC1Q8NHS4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLHC1Q8NHS4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLHC1Q8NHS4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLHC1Q8NHS4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CLHC1Q8NHS4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLHC1Q8NHS4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLHC1Q8NHS4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLHC1Q8NHS4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLHC1Q8NHS4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLHC1Q8NHS4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLHC1Q8NHS4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CLHC1Q8NHS4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLHC1Q8NHS4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CLHC1Q8NHS4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLHC1Q8NHS4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLHC1Q8NHS4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLHC1Q8NHS4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLHC1Q8NHS4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLHC1Q8NHS4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLHC1Q8NHS4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLHC1Q8NHS4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLHC1Q8NHS4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CLHC1Q8NHS4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLHC1Q8NHS4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLHC1Q8NHS4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLHC1Q8NHS4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLHC1Q8NHS4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLHC1Q8NHS4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLHC1Q8NHS4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLHC1Q8NHS4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLHC1Q8NHS4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLHC1Q8NHS4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLHC1Q8NHS4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLHC1Q8NHS4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLHC1Q8NHS4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLHC1Q8NHS4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLHC1Q8NHS4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLHC1Q8NHS4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLHC1Q8NHS4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLHC1Q8NHS4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLHC1Q8NHS4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLHC1Q8NHS4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLHC1Q8NHS4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLHC1Q8NHS4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLHC1Q8NHS4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLHC1Q8NHS4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLHC1Q8NHS4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLHC1Q8NHS4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLHC1Q8NHS4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLHC1Q8NHS4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLHC1Q8NHS4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLHC1Q8NHS4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLHC1Q8NHS4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLHC1Q8NHS4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLHC1Q8NHS4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLHC1Q8NHS4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLHC1Q8NHS4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CLHC1Q8NHS4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CLHC1Q8NHS4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLHC1Q8NHS4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLHC1Q8NHS4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLHC1Q8NHS4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLHC1Q8NHS4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLHC1Q8NHS4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLHC1Q8NHS4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms