Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH3

NUP43, Nucleoporin Nup43, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP43Q8NFH3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP43Q8NFH3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP43Q8NFH3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP43Q8NFH3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP43Q8NFH3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP43Q8NFH3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP43Q8NFH3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP43Q8NFH3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP43Q8NFH3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUP43Q8NFH3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUP43Q8NFH3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUP43Q8NFH3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NUP43Q8NFH3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NUP43Q8NFH3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NUP43Q8NFH3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NUP43Q8NFH3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP43Q8NFH3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP43Q8NFH3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP43Q8NFH3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP43Q8NFH3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP43Q8NFH3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP43Q8NFH3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP43Q8NFH3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP43Q8NFH3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP43Q8NFH3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP43Q8NFH3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP43Q8NFH3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP43Q8NFH3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP43Q8NFH3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP43Q8NFH3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP43Q8NFH3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP43Q8NFH3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP43Q8NFH3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP43Q8NFH3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP43Q8NFH3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP43Q8NFH3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP43Q8NFH3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP43Q8NFH3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP43Q8NFH3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP43Q8NFH3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP43Q8NFH3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP43Q8NFH3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP43Q8NFH3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP43Q8NFH3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP43Q8NFH3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP43Q8NFH3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP43Q8NFH3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP43Q8NFH3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP43Q8NFH3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP43Q8NFH3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP43Q8NFH3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP43Q8NFH3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP43Q8NFH3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUP43Q8NFH3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUP43Q8NFH3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP43Q8NFH3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP43Q8NFH3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP43Q8NFH3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP43Q8NFH3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP43Q8NFH3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP43Q8NFH3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP43Q8NFH3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP43Q8NFH3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP43Q8NFH3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP43Q8NFH3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP43Q8NFH3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP43Q8NFH3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP43Q8NFH3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP43Q8NFH3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP43Q8NFH3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP43Q8NFH3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP43Q8NFH3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP43Q8NFH3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP43Q8NFH3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP43Q8NFH3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP43Q8NFH3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP43Q8NFH3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP43Q8NFH3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP43Q8NFH3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP43Q8NFH3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP43Q8NFH3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP43Q8NFH3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP43Q8NFH3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP43Q8NFH3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP43Q8NFH3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP43Q8NFH3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP43Q8NFH3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP43Q8NFH3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP43Q8NFH3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP43Q8NFH3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP43Q8NFH3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP43Q8NFH3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP43Q8NFH3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP43Q8NFH3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP43Q8NFH3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP43Q8NFH3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP43Q8NFH3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP43Q8NFH3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP43Q8NFH3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP43Q8NFH3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms