Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEN9

PDZD8, PDZ domain-containing protein 8, humanhuman

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Length 1,154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD8Q8NEN9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDZD8Q8NEN9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDZD8Q8NEN9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDZD8Q8NEN9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDZD8Q8NEN9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDZD8Q8NEN9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDZD8Q8NEN9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDZD8Q8NEN9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDZD8Q8NEN9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDZD8Q8NEN9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PDZD8Q8NEN9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDZD8Q8NEN9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDZD8Q8NEN9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PDZD8Q8NEN9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDZD8Q8NEN9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDZD8Q8NEN9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDZD8Q8NEN9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDZD8Q8NEN9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDZD8Q8NEN9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDZD8Q8NEN9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDZD8Q8NEN9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PDZD8Q8NEN9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PDZD8Q8NEN9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDZD8Q8NEN9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDZD8Q8NEN9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PDZD8Q8NEN9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PDZD8Q8NEN9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PDZD8Q8NEN9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PDZD8Q8NEN9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PDZD8Q8NEN9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
PDZD8Q8NEN9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDZD8Q8NEN9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDZD8Q8NEN9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDZD8Q8NEN9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDZD8Q8NEN9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDZD8Q8NEN9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDZD8Q8NEN9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDZD8Q8NEN9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDZD8Q8NEN9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDZD8Q8NEN9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDZD8Q8NEN9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDZD8Q8NEN9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PDZD8Q8NEN9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDZD8Q8NEN9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDZD8Q8NEN9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDZD8Q8NEN9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDZD8Q8NEN9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDZD8Q8NEN9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDZD8Q8NEN9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDZD8Q8NEN9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDZD8Q8NEN9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDZD8Q8NEN9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDZD8Q8NEN9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDZD8Q8NEN9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDZD8Q8NEN9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PDZD8Q8NEN9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDZD8Q8NEN9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDZD8Q8NEN9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDZD8Q8NEN9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDZD8Q8NEN9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PDZD8Q8NEN9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PDZD8Q8NEN9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDZD8Q8NEN9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDZD8Q8NEN9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDZD8Q8NEN9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDZD8Q8NEN9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDZD8Q8NEN9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDZD8Q8NEN9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDZD8Q8NEN9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDZD8Q8NEN9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDZD8Q8NEN9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDZD8Q8NEN9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDZD8Q8NEN9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDZD8Q8NEN9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDZD8Q8NEN9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDZD8Q8NEN9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDZD8Q8NEN9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDZD8Q8NEN9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDZD8Q8NEN9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDZD8Q8NEN9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDZD8Q8NEN9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PDZD8Q8NEN9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDZD8Q8NEN9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDZD8Q8NEN9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDZD8Q8NEN9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDZD8Q8NEN9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDZD8Q8NEN9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDZD8Q8NEN9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDZD8Q8NEN9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDZD8Q8NEN9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDZD8Q8NEN9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDZD8Q8NEN9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDZD8Q8NEN9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDZD8Q8NEN9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDZD8Q8NEN9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDZD8Q8NEN9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDZD8Q8NEN9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDZD8Q8NEN9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDZD8Q8NEN9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDZD8Q8NEN9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
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