Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEC5

CATSPER1, Cation channel sperm-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER1Q8NEC5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CATSPER1Q8NEC5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CATSPER1Q8NEC5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CATSPER1Q8NEC5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CATSPER1Q8NEC5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CATSPER1Q8NEC5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CATSPER1Q8NEC5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CATSPER1Q8NEC5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CATSPER1Q8NEC5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CATSPER1Q8NEC5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CATSPER1Q8NEC5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CATSPER1Q8NEC5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CATSPER1Q8NEC5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CATSPER1Q8NEC5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CATSPER1Q8NEC5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CATSPER1Q8NEC5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CATSPER1Q8NEC5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CATSPER1Q8NEC5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CATSPER1Q8NEC5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CATSPER1Q8NEC5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CATSPER1Q8NEC5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CATSPER1Q8NEC5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CATSPER1Q8NEC5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CATSPER1Q8NEC5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CATSPER1Q8NEC5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CATSPER1Q8NEC5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CATSPER1Q8NEC5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CATSPER1Q8NEC5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CATSPER1Q8NEC5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CATSPER1Q8NEC5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CATSPER1Q8NEC5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CATSPER1Q8NEC5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CATSPER1Q8NEC5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CATSPER1Q8NEC5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CATSPER1Q8NEC5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CATSPER1Q8NEC5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CATSPER1Q8NEC5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CATSPER1Q8NEC5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CATSPER1Q8NEC5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CATSPER1Q8NEC5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CATSPER1Q8NEC5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CATSPER1Q8NEC5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CATSPER1Q8NEC5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CATSPER1Q8NEC5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CATSPER1Q8NEC5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CATSPER1Q8NEC5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CATSPER1Q8NEC5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CATSPER1Q8NEC5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CATSPER1Q8NEC5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CATSPER1Q8NEC5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CATSPER1Q8NEC5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CATSPER1Q8NEC5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CATSPER1Q8NEC5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CATSPER1Q8NEC5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CATSPER1Q8NEC5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CATSPER1Q8NEC5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CATSPER1Q8NEC5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CATSPER1Q8NEC5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CATSPER1Q8NEC5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CATSPER1Q8NEC5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CATSPER1Q8NEC5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CATSPER1Q8NEC5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CATSPER1Q8NEC5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CATSPER1Q8NEC5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CATSPER1Q8NEC5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CATSPER1Q8NEC5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CATSPER1Q8NEC5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CATSPER1Q8NEC5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CATSPER1Q8NEC5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CATSPER1Q8NEC5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CATSPER1Q8NEC5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CATSPER1Q8NEC5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CATSPER1Q8NEC5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CATSPER1Q8NEC5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CATSPER1Q8NEC5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CATSPER1Q8NEC5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CATSPER1Q8NEC5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CATSPER1Q8NEC5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CATSPER1Q8NEC5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CATSPER1Q8NEC5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CATSPER1Q8NEC5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CATSPER1Q8NEC5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CATSPER1Q8NEC5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CATSPER1Q8NEC5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CATSPER1Q8NEC5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CATSPER1Q8NEC5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CATSPER1Q8NEC5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CATSPER1Q8NEC5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CATSPER1Q8NEC5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CATSPER1Q8NEC5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CATSPER1Q8NEC5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CATSPER1Q8NEC5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CATSPER1Q8NEC5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CATSPER1Q8NEC5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CATSPER1Q8NEC5 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CATSPER1Q8NEC5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CATSPER1Q8NEC5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CATSPER1Q8NEC5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CATSPER1Q8NEC5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CATSPER1Q8NEC5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms