Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HJURPQ8NCD3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HJURPQ8NCD3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HJURPQ8NCD3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HJURPQ8NCD3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HJURPQ8NCD3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HJURPQ8NCD3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HJURPQ8NCD3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HJURPQ8NCD3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HJURPQ8NCD3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HJURPQ8NCD3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HJURPQ8NCD3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HJURPQ8NCD3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HJURPQ8NCD3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HJURPQ8NCD3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HJURPQ8NCD3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HJURPQ8NCD3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
HJURPQ8NCD3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HJURPQ8NCD3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HJURPQ8NCD3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HJURPQ8NCD3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HJURPQ8NCD3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HJURPQ8NCD3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HJURPQ8NCD3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HJURPQ8NCD3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HJURPQ8NCD3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HJURPQ8NCD3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HJURPQ8NCD3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HJURPQ8NCD3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HJURPQ8NCD3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HJURPQ8NCD3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HJURPQ8NCD3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HJURPQ8NCD3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HJURPQ8NCD3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HJURPQ8NCD3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HJURPQ8NCD3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HJURPQ8NCD3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HJURPQ8NCD3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HJURPQ8NCD3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HJURPQ8NCD3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HJURPQ8NCD3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HJURPQ8NCD3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HJURPQ8NCD3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HJURPQ8NCD3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HJURPQ8NCD3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HJURPQ8NCD3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HJURPQ8NCD3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HJURPQ8NCD3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
HJURPQ8NCD3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
HJURPQ8NCD3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
HJURPQ8NCD3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HJURPQ8NCD3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HJURPQ8NCD3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HJURPQ8NCD3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HJURPQ8NCD3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
HJURPQ8NCD3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HJURPQ8NCD3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HJURPQ8NCD3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
HJURPQ8NCD3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HJURPQ8NCD3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HJURPQ8NCD3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HJURPQ8NCD3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HJURPQ8NCD3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HJURPQ8NCD3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HJURPQ8NCD3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HJURPQ8NCD3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HJURPQ8NCD3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HJURPQ8NCD3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HJURPQ8NCD3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HJURPQ8NCD3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HJURPQ8NCD3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HJURPQ8NCD3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HJURPQ8NCD3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HJURPQ8NCD3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HJURPQ8NCD3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HJURPQ8NCD3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HJURPQ8NCD3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HJURPQ8NCD3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HJURPQ8NCD3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HJURPQ8NCD3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HJURPQ8NCD3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HJURPQ8NCD3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HJURPQ8NCD3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HJURPQ8NCD3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
HJURPQ8NCD3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HJURPQ8NCD3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HJURPQ8NCD3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HJURPQ8NCD3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HJURPQ8NCD3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HJURPQ8NCD3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HJURPQ8NCD3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HJURPQ8NCD3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HJURPQ8NCD3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HJURPQ8NCD3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HJURPQ8NCD3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HJURPQ8NCD3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HJURPQ8NCD3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HJURPQ8NCD3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HJURPQ8NCD3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HJURPQ8NCD3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms