Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC06

ACBD4, Acyl-CoA-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACBD4Q8NC06 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACBD4Q8NC06 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACBD4Q8NC06 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACBD4Q8NC06 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ACBD4Q8NC06 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACBD4Q8NC06 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACBD4Q8NC06 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACBD4Q8NC06 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACBD4Q8NC06 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ACBD4Q8NC06 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACBD4Q8NC06 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACBD4Q8NC06 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACBD4Q8NC06 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACBD4Q8NC06 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACBD4Q8NC06 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACBD4Q8NC06 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACBD4Q8NC06 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACBD4Q8NC06 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACBD4Q8NC06 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACBD4Q8NC06 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACBD4Q8NC06 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACBD4Q8NC06 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACBD4Q8NC06 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACBD4Q8NC06 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACBD4Q8NC06 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACBD4Q8NC06 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACBD4Q8NC06 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACBD4Q8NC06 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACBD4Q8NC06 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACBD4Q8NC06 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACBD4Q8NC06 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACBD4Q8NC06 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACBD4Q8NC06 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACBD4Q8NC06 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACBD4Q8NC06 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACBD4Q8NC06 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACBD4Q8NC06 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACBD4Q8NC06 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACBD4Q8NC06 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACBD4Q8NC06 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACBD4Q8NC06 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACBD4Q8NC06 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACBD4Q8NC06 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACBD4Q8NC06 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACBD4Q8NC06 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACBD4Q8NC06 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACBD4Q8NC06 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACBD4Q8NC06 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACBD4Q8NC06 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACBD4Q8NC06 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACBD4Q8NC06 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACBD4Q8NC06 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ACBD4Q8NC06 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACBD4Q8NC06 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACBD4Q8NC06 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACBD4Q8NC06 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACBD4Q8NC06 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACBD4Q8NC06 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACBD4Q8NC06 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACBD4Q8NC06 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACBD4Q8NC06 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACBD4Q8NC06 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACBD4Q8NC06 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ACBD4Q8NC06 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACBD4Q8NC06 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACBD4Q8NC06 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACBD4Q8NC06 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACBD4Q8NC06 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACBD4Q8NC06 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACBD4Q8NC06 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACBD4Q8NC06 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACBD4Q8NC06 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACBD4Q8NC06 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ACBD4Q8NC06 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACBD4Q8NC06 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACBD4Q8NC06 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACBD4Q8NC06 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACBD4Q8NC06 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACBD4Q8NC06 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACBD4Q8NC06 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACBD4Q8NC06 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACBD4Q8NC06 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACBD4Q8NC06 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACBD4Q8NC06 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACBD4Q8NC06 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACBD4Q8NC06 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACBD4Q8NC06 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACBD4Q8NC06 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACBD4Q8NC06 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACBD4Q8NC06 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACBD4Q8NC06 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ACBD4Q8NC06 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACBD4Q8NC06 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACBD4Q8NC06 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACBD4Q8NC06 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACBD4Q8NC06 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACBD4Q8NC06 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACBD4Q8NC06 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACBD4Q8NC06 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACBD4Q8NC06 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms