Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN3

TMEM87A, Transmembrane protein 87A, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87AQ8NBN3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMEM87AQ8NBN3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMEM87AQ8NBN3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMEM87AQ8NBN3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
TMEM87AQ8NBN3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMEM87AQ8NBN3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TMEM87AQ8NBN3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TMEM87AQ8NBN3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMEM87AQ8NBN3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMEM87AQ8NBN3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMEM87AQ8NBN3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMEM87AQ8NBN3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMEM87AQ8NBN3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMEM87AQ8NBN3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TMEM87AQ8NBN3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMEM87AQ8NBN3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMEM87AQ8NBN3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMEM87AQ8NBN3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TMEM87AQ8NBN3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMEM87AQ8NBN3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMEM87AQ8NBN3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMEM87AQ8NBN3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMEM87AQ8NBN3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMEM87AQ8NBN3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMEM87AQ8NBN3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMEM87AQ8NBN3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMEM87AQ8NBN3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMEM87AQ8NBN3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMEM87AQ8NBN3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
TMEM87AQ8NBN3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMEM87AQ8NBN3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMEM87AQ8NBN3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMEM87AQ8NBN3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMEM87AQ8NBN3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMEM87AQ8NBN3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMEM87AQ8NBN3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMEM87AQ8NBN3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMEM87AQ8NBN3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMEM87AQ8NBN3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMEM87AQ8NBN3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TMEM87AQ8NBN3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMEM87AQ8NBN3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMEM87AQ8NBN3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TMEM87AQ8NBN3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMEM87AQ8NBN3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMEM87AQ8NBN3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMEM87AQ8NBN3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TMEM87AQ8NBN3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMEM87AQ8NBN3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMEM87AQ8NBN3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMEM87AQ8NBN3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMEM87AQ8NBN3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMEM87AQ8NBN3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMEM87AQ8NBN3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMEM87AQ8NBN3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMEM87AQ8NBN3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMEM87AQ8NBN3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMEM87AQ8NBN3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TMEM87AQ8NBN3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TMEM87AQ8NBN3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TMEM87AQ8NBN3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TMEM87AQ8NBN3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TMEM87AQ8NBN3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TMEM87AQ8NBN3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TMEM87AQ8NBN3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
TMEM87AQ8NBN3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TMEM87AQ8NBN3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TMEM87AQ8NBN3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TMEM87AQ8NBN3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TMEM87AQ8NBN3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TMEM87AQ8NBN3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TMEM87AQ8NBN3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TMEM87AQ8NBN3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TMEM87AQ8NBN3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TMEM87AQ8NBN3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TMEM87AQ8NBN3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
TMEM87AQ8NBN3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TMEM87AQ8NBN3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TMEM87AQ8NBN3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TMEM87AQ8NBN3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TMEM87AQ8NBN3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
TMEM87AQ8NBN3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TMEM87AQ8NBN3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TMEM87AQ8NBN3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TMEM87AQ8NBN3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TMEM87AQ8NBN3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TMEM87AQ8NBN3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TMEM87AQ8NBN3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TMEM87AQ8NBN3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TMEM87AQ8NBN3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TMEM87AQ8NBN3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
TMEM87AQ8NBN3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMEM87AQ8NBN3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMEM87AQ8NBN3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMEM87AQ8NBN3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMEM87AQ8NBN3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMEM87AQ8NBN3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
TMEM87AQ8NBN3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMEM87AQ8NBN3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMEM87AQ8NBN3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms