Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBD8

TMEM229B, Transmembrane protein 229B, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM229BQ8NBD8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM229BQ8NBD8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM229BQ8NBD8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM229BQ8NBD8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM229BQ8NBD8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM229BQ8NBD8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM229BQ8NBD8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM229BQ8NBD8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM229BQ8NBD8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM229BQ8NBD8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM229BQ8NBD8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM229BQ8NBD8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM229BQ8NBD8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM229BQ8NBD8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM229BQ8NBD8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM229BQ8NBD8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM229BQ8NBD8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM229BQ8NBD8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM229BQ8NBD8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM229BQ8NBD8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM229BQ8NBD8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM229BQ8NBD8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM229BQ8NBD8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM229BQ8NBD8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM229BQ8NBD8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM229BQ8NBD8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM229BQ8NBD8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TMEM229BQ8NBD8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM229BQ8NBD8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM229BQ8NBD8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM229BQ8NBD8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM229BQ8NBD8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM229BQ8NBD8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM229BQ8NBD8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM229BQ8NBD8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM229BQ8NBD8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM229BQ8NBD8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM229BQ8NBD8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM229BQ8NBD8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM229BQ8NBD8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM229BQ8NBD8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM229BQ8NBD8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM229BQ8NBD8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM229BQ8NBD8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM229BQ8NBD8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM229BQ8NBD8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM229BQ8NBD8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM229BQ8NBD8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM229BQ8NBD8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM229BQ8NBD8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM229BQ8NBD8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM229BQ8NBD8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM229BQ8NBD8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM229BQ8NBD8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM229BQ8NBD8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM229BQ8NBD8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM229BQ8NBD8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM229BQ8NBD8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM229BQ8NBD8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM229BQ8NBD8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM229BQ8NBD8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM229BQ8NBD8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM229BQ8NBD8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM229BQ8NBD8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM229BQ8NBD8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM229BQ8NBD8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM229BQ8NBD8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM229BQ8NBD8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM229BQ8NBD8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM229BQ8NBD8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM229BQ8NBD8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM229BQ8NBD8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM229BQ8NBD8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM229BQ8NBD8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM229BQ8NBD8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM229BQ8NBD8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM229BQ8NBD8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM229BQ8NBD8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM229BQ8NBD8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM229BQ8NBD8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM229BQ8NBD8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM229BQ8NBD8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM229BQ8NBD8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM229BQ8NBD8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM229BQ8NBD8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM229BQ8NBD8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM229BQ8NBD8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM229BQ8NBD8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM229BQ8NBD8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM229BQ8NBD8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM229BQ8NBD8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM229BQ8NBD8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM229BQ8NBD8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM229BQ8NBD8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM229BQ8NBD8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM229BQ8NBD8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM229BQ8NBD8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM229BQ8NBD8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM229BQ8NBD8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM229BQ8NBD8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.6 ms