Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9Z9

LMNTD1, Lamin tail domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD1Q8N9Z9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMNTD1Q8N9Z9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMNTD1Q8N9Z9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMNTD1Q8N9Z9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LMNTD1Q8N9Z9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMNTD1Q8N9Z9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMNTD1Q8N9Z9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMNTD1Q8N9Z9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMNTD1Q8N9Z9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMNTD1Q8N9Z9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMNTD1Q8N9Z9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMNTD1Q8N9Z9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMNTD1Q8N9Z9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMNTD1Q8N9Z9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMNTD1Q8N9Z9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMNTD1Q8N9Z9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMNTD1Q8N9Z9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMNTD1Q8N9Z9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMNTD1Q8N9Z9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMNTD1Q8N9Z9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMNTD1Q8N9Z9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMNTD1Q8N9Z9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMNTD1Q8N9Z9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMNTD1Q8N9Z9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMNTD1Q8N9Z9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMNTD1Q8N9Z9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMNTD1Q8N9Z9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMNTD1Q8N9Z9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMNTD1Q8N9Z9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMNTD1Q8N9Z9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMNTD1Q8N9Z9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMNTD1Q8N9Z9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMNTD1Q8N9Z9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMNTD1Q8N9Z9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMNTD1Q8N9Z9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMNTD1Q8N9Z9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMNTD1Q8N9Z9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMNTD1Q8N9Z9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMNTD1Q8N9Z9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMNTD1Q8N9Z9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMNTD1Q8N9Z9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMNTD1Q8N9Z9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMNTD1Q8N9Z9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMNTD1Q8N9Z9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMNTD1Q8N9Z9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMNTD1Q8N9Z9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMNTD1Q8N9Z9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMNTD1Q8N9Z9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMNTD1Q8N9Z9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMNTD1Q8N9Z9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMNTD1Q8N9Z9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMNTD1Q8N9Z9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMNTD1Q8N9Z9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LMNTD1Q8N9Z9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMNTD1Q8N9Z9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMNTD1Q8N9Z9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMNTD1Q8N9Z9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMNTD1Q8N9Z9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMNTD1Q8N9Z9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMNTD1Q8N9Z9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMNTD1Q8N9Z9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMNTD1Q8N9Z9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMNTD1Q8N9Z9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMNTD1Q8N9Z9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LMNTD1Q8N9Z9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMNTD1Q8N9Z9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMNTD1Q8N9Z9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMNTD1Q8N9Z9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LMNTD1Q8N9Z9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LMNTD1Q8N9Z9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LMNTD1Q8N9Z9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LMNTD1Q8N9Z9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LMNTD1Q8N9Z9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LMNTD1Q8N9Z9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LMNTD1Q8N9Z9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LMNTD1Q8N9Z9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMNTD1Q8N9Z9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMNTD1Q8N9Z9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMNTD1Q8N9Z9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMNTD1Q8N9Z9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMNTD1Q8N9Z9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMNTD1Q8N9Z9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LMNTD1Q8N9Z9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMNTD1Q8N9Z9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMNTD1Q8N9Z9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMNTD1Q8N9Z9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMNTD1Q8N9Z9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LMNTD1Q8N9Z9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMNTD1Q8N9Z9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMNTD1Q8N9Z9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMNTD1Q8N9Z9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMNTD1Q8N9Z9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMNTD1Q8N9Z9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LMNTD1Q8N9Z9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMNTD1Q8N9Z9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMNTD1Q8N9Z9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMNTD1Q8N9Z9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMNTD1Q8N9Z9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMNTD1Q8N9Z9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMNTD1Q8N9Z9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms