Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
RNF148Q8N7C7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF148Q8N7C7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF148Q8N7C7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF148Q8N7C7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF148Q8N7C7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF148Q8N7C7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF148Q8N7C7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF148Q8N7C7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF148Q8N7C7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF148Q8N7C7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF148Q8N7C7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF148Q8N7C7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF148Q8N7C7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF148Q8N7C7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF148Q8N7C7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF148Q8N7C7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF148Q8N7C7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF148Q8N7C7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF148Q8N7C7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF148Q8N7C7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF148Q8N7C7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF148Q8N7C7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF148Q8N7C7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF148Q8N7C7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF148Q8N7C7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF148Q8N7C7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF148Q8N7C7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF148Q8N7C7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF148Q8N7C7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF148Q8N7C7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF148Q8N7C7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF148Q8N7C7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF148Q8N7C7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF148Q8N7C7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF148Q8N7C7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF148Q8N7C7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF148Q8N7C7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF148Q8N7C7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF148Q8N7C7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF148Q8N7C7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF148Q8N7C7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF148Q8N7C7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF148Q8N7C7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF148Q8N7C7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF148Q8N7C7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF148Q8N7C7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF148Q8N7C7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF148Q8N7C7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF148Q8N7C7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF148Q8N7C7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF148Q8N7C7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RNF148Q8N7C7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF148Q8N7C7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF148Q8N7C7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF148Q8N7C7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF148Q8N7C7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF148Q8N7C7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF148Q8N7C7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF148Q8N7C7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF148Q8N7C7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF148Q8N7C7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF148Q8N7C7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF148Q8N7C7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF148Q8N7C7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF148Q8N7C7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF148Q8N7C7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF148Q8N7C7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF148Q8N7C7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF148Q8N7C7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF148Q8N7C7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF148Q8N7C7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF148Q8N7C7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF148Q8N7C7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF148Q8N7C7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF148Q8N7C7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF148Q8N7C7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF148Q8N7C7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF148Q8N7C7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF148Q8N7C7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF148Q8N7C7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF148Q8N7C7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF148Q8N7C7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RNF148Q8N7C7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RNF148Q8N7C7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RNF148Q8N7C7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RNF148Q8N7C7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF148Q8N7C7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF148Q8N7C7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF148Q8N7C7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF148Q8N7C7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF148Q8N7C7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF148Q8N7C7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF148Q8N7C7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF148Q8N7C7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF148Q8N7C7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF148Q8N7C7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF148Q8N7C7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF148Q8N7C7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF148Q8N7C7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
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