Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7B6

PACRGL, PACRG-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACRGLQ8N7B6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PACRGLQ8N7B6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PACRGLQ8N7B6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PACRGLQ8N7B6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PACRGLQ8N7B6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PACRGLQ8N7B6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PACRGLQ8N7B6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PACRGLQ8N7B6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PACRGLQ8N7B6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PACRGLQ8N7B6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PACRGLQ8N7B6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PACRGLQ8N7B6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PACRGLQ8N7B6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PACRGLQ8N7B6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PACRGLQ8N7B6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PACRGLQ8N7B6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PACRGLQ8N7B6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PACRGLQ8N7B6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PACRGLQ8N7B6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PACRGLQ8N7B6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PACRGLQ8N7B6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PACRGLQ8N7B6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PACRGLQ8N7B6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PACRGLQ8N7B6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PACRGLQ8N7B6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PACRGLQ8N7B6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PACRGLQ8N7B6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PACRGLQ8N7B6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PACRGLQ8N7B6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PACRGLQ8N7B6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PACRGLQ8N7B6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PACRGLQ8N7B6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PACRGLQ8N7B6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PACRGLQ8N7B6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PACRGLQ8N7B6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PACRGLQ8N7B6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PACRGLQ8N7B6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PACRGLQ8N7B6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PACRGLQ8N7B6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PACRGLQ8N7B6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PACRGLQ8N7B6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PACRGLQ8N7B6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PACRGLQ8N7B6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PACRGLQ8N7B6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PACRGLQ8N7B6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PACRGLQ8N7B6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PACRGLQ8N7B6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PACRGLQ8N7B6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PACRGLQ8N7B6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PACRGLQ8N7B6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PACRGLQ8N7B6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PACRGLQ8N7B6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PACRGLQ8N7B6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PACRGLQ8N7B6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PACRGLQ8N7B6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PACRGLQ8N7B6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PACRGLQ8N7B6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PACRGLQ8N7B6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PACRGLQ8N7B6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PACRGLQ8N7B6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PACRGLQ8N7B6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PACRGLQ8N7B6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PACRGLQ8N7B6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PACRGLQ8N7B6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PACRGLQ8N7B6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PACRGLQ8N7B6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PACRGLQ8N7B6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PACRGLQ8N7B6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PACRGLQ8N7B6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PACRGLQ8N7B6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PACRGLQ8N7B6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PACRGLQ8N7B6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PACRGLQ8N7B6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PACRGLQ8N7B6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PACRGLQ8N7B6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PACRGLQ8N7B6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PACRGLQ8N7B6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PACRGLQ8N7B6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PACRGLQ8N7B6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PACRGLQ8N7B6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PACRGLQ8N7B6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PACRGLQ8N7B6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PACRGLQ8N7B6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PACRGLQ8N7B6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PACRGLQ8N7B6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PACRGLQ8N7B6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PACRGLQ8N7B6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PACRGLQ8N7B6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PACRGLQ8N7B6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PACRGLQ8N7B6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PACRGLQ8N7B6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PACRGLQ8N7B6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PACRGLQ8N7B6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PACRGLQ8N7B6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PACRGLQ8N7B6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PACRGLQ8N7B6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PACRGLQ8N7B6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PACRGLQ8N7B6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PACRGLQ8N7B6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PACRGLQ8N7B6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 172.6 ms