Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6N3

C1orf52, UPF0690 protein C1orf52, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf52Q8N6N3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1orf52Q8N6N3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
C1orf52Q8N6N3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1orf52Q8N6N3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1orf52Q8N6N3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C1orf52Q8N6N3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C1orf52Q8N6N3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C1orf52Q8N6N3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
C1orf52Q8N6N3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1orf52Q8N6N3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
C1orf52Q8N6N3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1orf52Q8N6N3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1orf52Q8N6N3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1orf52Q8N6N3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1orf52Q8N6N3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1orf52Q8N6N3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
C1orf52Q8N6N3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1orf52Q8N6N3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1orf52Q8N6N3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1orf52Q8N6N3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1orf52Q8N6N3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1orf52Q8N6N3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1orf52Q8N6N3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1orf52Q8N6N3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1orf52Q8N6N3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1orf52Q8N6N3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1orf52Q8N6N3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1orf52Q8N6N3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1orf52Q8N6N3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1orf52Q8N6N3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1orf52Q8N6N3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1orf52Q8N6N3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1orf52Q8N6N3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1orf52Q8N6N3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1orf52Q8N6N3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1orf52Q8N6N3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1orf52Q8N6N3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1orf52Q8N6N3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1orf52Q8N6N3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1orf52Q8N6N3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1orf52Q8N6N3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1orf52Q8N6N3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
C1orf52Q8N6N3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1orf52Q8N6N3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1orf52Q8N6N3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1orf52Q8N6N3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1orf52Q8N6N3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
C1orf52Q8N6N3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1orf52Q8N6N3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1orf52Q8N6N3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1orf52Q8N6N3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1orf52Q8N6N3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
C1orf52Q8N6N3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1orf52Q8N6N3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1orf52Q8N6N3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1orf52Q8N6N3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1orf52Q8N6N3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1orf52Q8N6N3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1orf52Q8N6N3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1orf52Q8N6N3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1orf52Q8N6N3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1orf52Q8N6N3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
C1orf52Q8N6N3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1orf52Q8N6N3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1orf52Q8N6N3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1orf52Q8N6N3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1orf52Q8N6N3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1orf52Q8N6N3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
C1orf52Q8N6N3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1orf52Q8N6N3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1orf52Q8N6N3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1orf52Q8N6N3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1orf52Q8N6N3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1orf52Q8N6N3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1orf52Q8N6N3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1orf52Q8N6N3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1orf52Q8N6N3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1orf52Q8N6N3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1orf52Q8N6N3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1orf52Q8N6N3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1orf52Q8N6N3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1orf52Q8N6N3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1orf52Q8N6N3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1orf52Q8N6N3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1orf52Q8N6N3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1orf52Q8N6N3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1orf52Q8N6N3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1orf52Q8N6N3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1orf52Q8N6N3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1orf52Q8N6N3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1orf52Q8N6N3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1orf52Q8N6N3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1orf52Q8N6N3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1orf52Q8N6N3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1orf52Q8N6N3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1orf52Q8N6N3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1orf52Q8N6N3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1orf52Q8N6N3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1orf52Q8N6N3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1orf52Q8N6N3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.2 ms