Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6L1

KRTCAP2, Keratinocyte-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTCAP2Q8N6L1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRTCAP2Q8N6L1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRTCAP2Q8N6L1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRTCAP2Q8N6L1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRTCAP2Q8N6L1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRTCAP2Q8N6L1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KRTCAP2Q8N6L1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRTCAP2Q8N6L1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRTCAP2Q8N6L1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRTCAP2Q8N6L1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRTCAP2Q8N6L1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRTCAP2Q8N6L1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRTCAP2Q8N6L1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRTCAP2Q8N6L1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRTCAP2Q8N6L1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRTCAP2Q8N6L1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRTCAP2Q8N6L1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KRTCAP2Q8N6L1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRTCAP2Q8N6L1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRTCAP2Q8N6L1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRTCAP2Q8N6L1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRTCAP2Q8N6L1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRTCAP2Q8N6L1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRTCAP2Q8N6L1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRTCAP2Q8N6L1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRTCAP2Q8N6L1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRTCAP2Q8N6L1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRTCAP2Q8N6L1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRTCAP2Q8N6L1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRTCAP2Q8N6L1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRTCAP2Q8N6L1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRTCAP2Q8N6L1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRTCAP2Q8N6L1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRTCAP2Q8N6L1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRTCAP2Q8N6L1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRTCAP2Q8N6L1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRTCAP2Q8N6L1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRTCAP2Q8N6L1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRTCAP2Q8N6L1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRTCAP2Q8N6L1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRTCAP2Q8N6L1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRTCAP2Q8N6L1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRTCAP2Q8N6L1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRTCAP2Q8N6L1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRTCAP2Q8N6L1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRTCAP2Q8N6L1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KRTCAP2Q8N6L1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRTCAP2Q8N6L1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRTCAP2Q8N6L1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRTCAP2Q8N6L1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRTCAP2Q8N6L1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KRTCAP2Q8N6L1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRTCAP2Q8N6L1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRTCAP2Q8N6L1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRTCAP2Q8N6L1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
KRTCAP2Q8N6L1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
KRTCAP2Q8N6L1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRTCAP2Q8N6L1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRTCAP2Q8N6L1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KRTCAP2Q8N6L1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRTCAP2Q8N6L1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRTCAP2Q8N6L1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRTCAP2Q8N6L1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRTCAP2Q8N6L1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRTCAP2Q8N6L1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KRTCAP2Q8N6L1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRTCAP2Q8N6L1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRTCAP2Q8N6L1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRTCAP2Q8N6L1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRTCAP2Q8N6L1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRTCAP2Q8N6L1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRTCAP2Q8N6L1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRTCAP2Q8N6L1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRTCAP2Q8N6L1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRTCAP2Q8N6L1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRTCAP2Q8N6L1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRTCAP2Q8N6L1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRTCAP2Q8N6L1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRTCAP2Q8N6L1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRTCAP2Q8N6L1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRTCAP2Q8N6L1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRTCAP2Q8N6L1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRTCAP2Q8N6L1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRTCAP2Q8N6L1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRTCAP2Q8N6L1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRTCAP2Q8N6L1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRTCAP2Q8N6L1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRTCAP2Q8N6L1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRTCAP2Q8N6L1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRTCAP2Q8N6L1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRTCAP2Q8N6L1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRTCAP2Q8N6L1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRTCAP2Q8N6L1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRTCAP2Q8N6L1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRTCAP2Q8N6L1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRTCAP2Q8N6L1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRTCAP2Q8N6L1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRTCAP2Q8N6L1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KRTCAP2Q8N6L1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
KRTCAP2Q8N6L1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.3 ms