Protein–RNA interactions for Protein: Q8N144

GJD3, Gap junction delta-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD3Q8N144 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJD3Q8N144 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJD3Q8N144 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJD3Q8N144 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJD3Q8N144 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GJD3Q8N144 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJD3Q8N144 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJD3Q8N144 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GJD3Q8N144 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJD3Q8N144 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJD3Q8N144 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJD3Q8N144 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJD3Q8N144 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJD3Q8N144 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJD3Q8N144 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJD3Q8N144 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GJD3Q8N144 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJD3Q8N144 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJD3Q8N144 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GJD3Q8N144 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GJD3Q8N144 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GJD3Q8N144 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GJD3Q8N144 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GJD3Q8N144 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GJD3Q8N144 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GJD3Q8N144 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GJD3Q8N144 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GJD3Q8N144 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GJD3Q8N144 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJD3Q8N144 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJD3Q8N144 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJD3Q8N144 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
GJD3Q8N144 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJD3Q8N144 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJD3Q8N144 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJD3Q8N144 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJD3Q8N144 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GJD3Q8N144 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GJD3Q8N144 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GJD3Q8N144 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GJD3Q8N144 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GJD3Q8N144 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GJD3Q8N144 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GJD3Q8N144 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GJD3Q8N144 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GJD3Q8N144 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GJD3Q8N144 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GJD3Q8N144 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
GJD3Q8N144 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GJD3Q8N144 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GJD3Q8N144 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
GJD3Q8N144 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GJD3Q8N144 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GJD3Q8N144 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GJD3Q8N144 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GJD3Q8N144 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GJD3Q8N144 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GJD3Q8N144 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GJD3Q8N144 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GJD3Q8N144 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJD3Q8N144 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJD3Q8N144 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJD3Q8N144 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJD3Q8N144 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GJD3Q8N144 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GJD3Q8N144 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GJD3Q8N144 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJD3Q8N144 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJD3Q8N144 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJD3Q8N144 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJD3Q8N144 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJD3Q8N144 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJD3Q8N144 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJD3Q8N144 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJD3Q8N144 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJD3Q8N144 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJD3Q8N144 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJD3Q8N144 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJD3Q8N144 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJD3Q8N144 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJD3Q8N144 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJD3Q8N144 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJD3Q8N144 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GJD3Q8N144 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJD3Q8N144 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJD3Q8N144 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJD3Q8N144 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJD3Q8N144 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GJD3Q8N144 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GJD3Q8N144 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GJD3Q8N144 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GJD3Q8N144 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
GJD3Q8N144 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GJD3Q8N144 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GJD3Q8N144 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GJD3Q8N144 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GJD3Q8N144 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GJD3Q8N144 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GJD3Q8N144 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GJD3Q8N144 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms