Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU3

SYCP3, Synaptonemal complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP3Q8IZU3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYCP3Q8IZU3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SYCP3Q8IZU3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYCP3Q8IZU3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYCP3Q8IZU3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYCP3Q8IZU3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYCP3Q8IZU3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYCP3Q8IZU3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYCP3Q8IZU3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SYCP3Q8IZU3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYCP3Q8IZU3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYCP3Q8IZU3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYCP3Q8IZU3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYCP3Q8IZU3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYCP3Q8IZU3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYCP3Q8IZU3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYCP3Q8IZU3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYCP3Q8IZU3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYCP3Q8IZU3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SYCP3Q8IZU3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYCP3Q8IZU3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SYCP3Q8IZU3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYCP3Q8IZU3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYCP3Q8IZU3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SYCP3Q8IZU3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYCP3Q8IZU3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYCP3Q8IZU3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYCP3Q8IZU3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYCP3Q8IZU3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYCP3Q8IZU3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYCP3Q8IZU3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYCP3Q8IZU3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYCP3Q8IZU3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYCP3Q8IZU3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYCP3Q8IZU3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYCP3Q8IZU3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYCP3Q8IZU3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYCP3Q8IZU3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYCP3Q8IZU3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYCP3Q8IZU3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYCP3Q8IZU3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYCP3Q8IZU3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYCP3Q8IZU3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYCP3Q8IZU3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYCP3Q8IZU3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYCP3Q8IZU3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYCP3Q8IZU3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYCP3Q8IZU3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYCP3Q8IZU3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYCP3Q8IZU3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYCP3Q8IZU3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYCP3Q8IZU3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SYCP3Q8IZU3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SYCP3Q8IZU3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYCP3Q8IZU3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYCP3Q8IZU3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYCP3Q8IZU3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYCP3Q8IZU3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SYCP3Q8IZU3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYCP3Q8IZU3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYCP3Q8IZU3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYCP3Q8IZU3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYCP3Q8IZU3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SYCP3Q8IZU3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYCP3Q8IZU3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYCP3Q8IZU3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYCP3Q8IZU3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYCP3Q8IZU3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYCP3Q8IZU3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYCP3Q8IZU3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYCP3Q8IZU3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYCP3Q8IZU3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYCP3Q8IZU3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYCP3Q8IZU3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYCP3Q8IZU3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYCP3Q8IZU3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYCP3Q8IZU3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SYCP3Q8IZU3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYCP3Q8IZU3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SYCP3Q8IZU3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYCP3Q8IZU3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYCP3Q8IZU3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYCP3Q8IZU3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYCP3Q8IZU3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SYCP3Q8IZU3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYCP3Q8IZU3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SYCP3Q8IZU3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYCP3Q8IZU3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYCP3Q8IZU3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYCP3Q8IZU3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYCP3Q8IZU3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYCP3Q8IZU3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYCP3Q8IZU3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYCP3Q8IZU3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYCP3Q8IZU3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYCP3Q8IZU3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SYCP3Q8IZU3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SYCP3Q8IZU3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYCP3Q8IZU3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYCP3Q8IZU3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms