Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYA6

CKAP2L, Cytoskeleton-associated protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP2LQ8IYA6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CKAP2LQ8IYA6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CKAP2LQ8IYA6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CKAP2LQ8IYA6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CKAP2LQ8IYA6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CKAP2LQ8IYA6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CKAP2LQ8IYA6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
CKAP2LQ8IYA6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CKAP2LQ8IYA6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CKAP2LQ8IYA6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CKAP2LQ8IYA6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CKAP2LQ8IYA6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CKAP2LQ8IYA6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CKAP2LQ8IYA6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CKAP2LQ8IYA6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CKAP2LQ8IYA6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CKAP2LQ8IYA6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CKAP2LQ8IYA6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CKAP2LQ8IYA6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CKAP2LQ8IYA6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CKAP2LQ8IYA6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CKAP2LQ8IYA6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CKAP2LQ8IYA6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CKAP2LQ8IYA6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CKAP2LQ8IYA6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CKAP2LQ8IYA6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CKAP2LQ8IYA6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CKAP2LQ8IYA6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CKAP2LQ8IYA6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CKAP2LQ8IYA6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CKAP2LQ8IYA6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CKAP2LQ8IYA6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CKAP2LQ8IYA6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CKAP2LQ8IYA6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CKAP2LQ8IYA6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CKAP2LQ8IYA6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CKAP2LQ8IYA6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CKAP2LQ8IYA6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CKAP2LQ8IYA6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CKAP2LQ8IYA6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CKAP2LQ8IYA6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CKAP2LQ8IYA6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CKAP2LQ8IYA6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CKAP2LQ8IYA6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CKAP2LQ8IYA6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CKAP2LQ8IYA6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CKAP2LQ8IYA6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CKAP2LQ8IYA6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CKAP2LQ8IYA6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CKAP2LQ8IYA6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CKAP2LQ8IYA6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CKAP2LQ8IYA6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CKAP2LQ8IYA6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CKAP2LQ8IYA6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CKAP2LQ8IYA6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CKAP2LQ8IYA6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CKAP2LQ8IYA6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CKAP2LQ8IYA6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CKAP2LQ8IYA6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CKAP2LQ8IYA6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CKAP2LQ8IYA6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CKAP2LQ8IYA6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CKAP2LQ8IYA6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CKAP2LQ8IYA6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CKAP2LQ8IYA6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CKAP2LQ8IYA6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CKAP2LQ8IYA6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CKAP2LQ8IYA6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CKAP2LQ8IYA6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CKAP2LQ8IYA6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CKAP2LQ8IYA6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CKAP2LQ8IYA6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CKAP2LQ8IYA6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CKAP2LQ8IYA6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CKAP2LQ8IYA6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CKAP2LQ8IYA6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CKAP2LQ8IYA6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CKAP2LQ8IYA6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CKAP2LQ8IYA6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CKAP2LQ8IYA6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CKAP2LQ8IYA6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CKAP2LQ8IYA6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CKAP2LQ8IYA6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CKAP2LQ8IYA6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CKAP2LQ8IYA6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CKAP2LQ8IYA6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CKAP2LQ8IYA6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CKAP2LQ8IYA6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CKAP2LQ8IYA6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CKAP2LQ8IYA6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CKAP2LQ8IYA6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CKAP2LQ8IYA6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CKAP2LQ8IYA6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CKAP2LQ8IYA6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CKAP2LQ8IYA6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CKAP2LQ8IYA6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CKAP2LQ8IYA6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CKAP2LQ8IYA6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CKAP2LQ8IYA6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CKAP2LQ8IYA6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.4 ms