Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUZ0

LRRC49, Leucine-rich repeat-containing protein 49, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC49Q8IUZ0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC49Q8IUZ0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC49Q8IUZ0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC49Q8IUZ0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC49Q8IUZ0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC49Q8IUZ0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC49Q8IUZ0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC49Q8IUZ0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC49Q8IUZ0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC49Q8IUZ0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC49Q8IUZ0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC49Q8IUZ0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC49Q8IUZ0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC49Q8IUZ0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC49Q8IUZ0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC49Q8IUZ0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC49Q8IUZ0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRC49Q8IUZ0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC49Q8IUZ0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC49Q8IUZ0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC49Q8IUZ0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC49Q8IUZ0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC49Q8IUZ0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC49Q8IUZ0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC49Q8IUZ0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC49Q8IUZ0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC49Q8IUZ0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC49Q8IUZ0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC49Q8IUZ0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC49Q8IUZ0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC49Q8IUZ0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC49Q8IUZ0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC49Q8IUZ0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC49Q8IUZ0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC49Q8IUZ0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC49Q8IUZ0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC49Q8IUZ0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC49Q8IUZ0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC49Q8IUZ0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC49Q8IUZ0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC49Q8IUZ0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC49Q8IUZ0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC49Q8IUZ0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC49Q8IUZ0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC49Q8IUZ0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC49Q8IUZ0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC49Q8IUZ0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC49Q8IUZ0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC49Q8IUZ0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC49Q8IUZ0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC49Q8IUZ0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC49Q8IUZ0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC49Q8IUZ0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC49Q8IUZ0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC49Q8IUZ0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC49Q8IUZ0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC49Q8IUZ0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC49Q8IUZ0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC49Q8IUZ0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC49Q8IUZ0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC49Q8IUZ0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC49Q8IUZ0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC49Q8IUZ0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC49Q8IUZ0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC49Q8IUZ0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC49Q8IUZ0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC49Q8IUZ0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC49Q8IUZ0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC49Q8IUZ0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC49Q8IUZ0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC49Q8IUZ0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC49Q8IUZ0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC49Q8IUZ0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC49Q8IUZ0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC49Q8IUZ0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC49Q8IUZ0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC49Q8IUZ0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC49Q8IUZ0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC49Q8IUZ0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC49Q8IUZ0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC49Q8IUZ0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC49Q8IUZ0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC49Q8IUZ0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC49Q8IUZ0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC49Q8IUZ0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC49Q8IUZ0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC49Q8IUZ0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC49Q8IUZ0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC49Q8IUZ0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC49Q8IUZ0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC49Q8IUZ0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC49Q8IUZ0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC49Q8IUZ0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC49Q8IUZ0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC49Q8IUZ0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC49Q8IUZ0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC49Q8IUZ0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC49Q8IUZ0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC49Q8IUZ0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC49Q8IUZ0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms