Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAB11FIP4Q86YS3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAB11FIP4Q86YS3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAB11FIP4Q86YS3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAB11FIP4Q86YS3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAB11FIP4Q86YS3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAB11FIP4Q86YS3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAB11FIP4Q86YS3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAB11FIP4Q86YS3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAB11FIP4Q86YS3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
RAB11FIP4Q86YS3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAB11FIP4Q86YS3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAB11FIP4Q86YS3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAB11FIP4Q86YS3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAB11FIP4Q86YS3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAB11FIP4Q86YS3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAB11FIP4Q86YS3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAB11FIP4Q86YS3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAB11FIP4Q86YS3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAB11FIP4Q86YS3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
RAB11FIP4Q86YS3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAB11FIP4Q86YS3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RAB11FIP4Q86YS3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RAB11FIP4Q86YS3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RAB11FIP4Q86YS3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RAB11FIP4Q86YS3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
RAB11FIP4Q86YS3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RAB11FIP4Q86YS3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RAB11FIP4Q86YS3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RAB11FIP4Q86YS3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RAB11FIP4Q86YS3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RAB11FIP4Q86YS3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RAB11FIP4Q86YS3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RAB11FIP4Q86YS3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RAB11FIP4Q86YS3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RAB11FIP4Q86YS3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RAB11FIP4Q86YS3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RAB11FIP4Q86YS3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RAB11FIP4Q86YS3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RAB11FIP4Q86YS3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RAB11FIP4Q86YS3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RAB11FIP4Q86YS3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RAB11FIP4Q86YS3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RAB11FIP4Q86YS3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RAB11FIP4Q86YS3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RAB11FIP4Q86YS3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RAB11FIP4Q86YS3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RAB11FIP4Q86YS3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RAB11FIP4Q86YS3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
RAB11FIP4Q86YS3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RAB11FIP4Q86YS3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RAB11FIP4Q86YS3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RAB11FIP4Q86YS3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RAB11FIP4Q86YS3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAB11FIP4Q86YS3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAB11FIP4Q86YS3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAB11FIP4Q86YS3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAB11FIP4Q86YS3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAB11FIP4Q86YS3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAB11FIP4Q86YS3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAB11FIP4Q86YS3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAB11FIP4Q86YS3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAB11FIP4Q86YS3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAB11FIP4Q86YS3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAB11FIP4Q86YS3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAB11FIP4Q86YS3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAB11FIP4Q86YS3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
RAB11FIP4Q86YS3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAB11FIP4Q86YS3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAB11FIP4Q86YS3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
RAB11FIP4Q86YS3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAB11FIP4Q86YS3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
RAB11FIP4Q86YS3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAB11FIP4Q86YS3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAB11FIP4Q86YS3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAB11FIP4Q86YS3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAB11FIP4Q86YS3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAB11FIP4Q86YS3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAB11FIP4Q86YS3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
RAB11FIP4Q86YS3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAB11FIP4Q86YS3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAB11FIP4Q86YS3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAB11FIP4Q86YS3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RAB11FIP4Q86YS3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RAB11FIP4Q86YS3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RAB11FIP4Q86YS3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RAB11FIP4Q86YS3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RAB11FIP4Q86YS3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RAB11FIP4Q86YS3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RAB11FIP4Q86YS3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RAB11FIP4Q86YS3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RAB11FIP4Q86YS3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RAB11FIP4Q86YS3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RAB11FIP4Q86YS3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
RAB11FIP4Q86YS3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RAB11FIP4Q86YS3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RAB11FIP4Q86YS3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms