Protein–RNA interactions for Protein: Q86YC2

PALB2, Partner and localizer of BRCA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALB2Q86YC2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PALB2Q86YC2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PALB2Q86YC2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PALB2Q86YC2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PALB2Q86YC2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PALB2Q86YC2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PALB2Q86YC2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PALB2Q86YC2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PALB2Q86YC2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PALB2Q86YC2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PALB2Q86YC2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PALB2Q86YC2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PALB2Q86YC2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PALB2Q86YC2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PALB2Q86YC2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PALB2Q86YC2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PALB2Q86YC2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PALB2Q86YC2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PALB2Q86YC2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PALB2Q86YC2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PALB2Q86YC2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PALB2Q86YC2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PALB2Q86YC2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PALB2Q86YC2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PALB2Q86YC2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PALB2Q86YC2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PALB2Q86YC2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PALB2Q86YC2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PALB2Q86YC2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PALB2Q86YC2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PALB2Q86YC2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PALB2Q86YC2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PALB2Q86YC2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PALB2Q86YC2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PALB2Q86YC2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PALB2Q86YC2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PALB2Q86YC2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PALB2Q86YC2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PALB2Q86YC2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PALB2Q86YC2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PALB2Q86YC2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PALB2Q86YC2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PALB2Q86YC2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PALB2Q86YC2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PALB2Q86YC2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PALB2Q86YC2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PALB2Q86YC2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PALB2Q86YC2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PALB2Q86YC2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PALB2Q86YC2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PALB2Q86YC2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PALB2Q86YC2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PALB2Q86YC2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PALB2Q86YC2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PALB2Q86YC2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PALB2Q86YC2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PALB2Q86YC2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PALB2Q86YC2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PALB2Q86YC2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PALB2Q86YC2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PALB2Q86YC2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PALB2Q86YC2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PALB2Q86YC2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PALB2Q86YC2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PALB2Q86YC2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PALB2Q86YC2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PALB2Q86YC2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PALB2Q86YC2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PALB2Q86YC2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PALB2Q86YC2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PALB2Q86YC2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PALB2Q86YC2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PALB2Q86YC2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PALB2Q86YC2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PALB2Q86YC2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PALB2Q86YC2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PALB2Q86YC2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PALB2Q86YC2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PALB2Q86YC2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PALB2Q86YC2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PALB2Q86YC2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PALB2Q86YC2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PALB2Q86YC2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PALB2Q86YC2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PALB2Q86YC2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PALB2Q86YC2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PALB2Q86YC2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PALB2Q86YC2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PALB2Q86YC2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PALB2Q86YC2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PALB2Q86YC2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PALB2Q86YC2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PALB2Q86YC2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PALB2Q86YC2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PALB2Q86YC2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PALB2Q86YC2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PALB2Q86YC2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PALB2Q86YC2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PALB2Q86YC2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PALB2Q86YC2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms