Protein–RNA interactions for Protein: Q86VZ5

SGMS1, Phosphatidylcholine:ceramide cholinephosphotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1Q86VZ5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SGMS1Q86VZ5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SGMS1Q86VZ5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SGMS1Q86VZ5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SGMS1Q86VZ5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SGMS1Q86VZ5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SGMS1Q86VZ5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SGMS1Q86VZ5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SGMS1Q86VZ5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SGMS1Q86VZ5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SGMS1Q86VZ5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SGMS1Q86VZ5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SGMS1Q86VZ5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SGMS1Q86VZ5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SGMS1Q86VZ5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SGMS1Q86VZ5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SGMS1Q86VZ5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SGMS1Q86VZ5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SGMS1Q86VZ5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SGMS1Q86VZ5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SGMS1Q86VZ5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SGMS1Q86VZ5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SGMS1Q86VZ5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SGMS1Q86VZ5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SGMS1Q86VZ5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SGMS1Q86VZ5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SGMS1Q86VZ5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SGMS1Q86VZ5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SGMS1Q86VZ5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SGMS1Q86VZ5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SGMS1Q86VZ5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SGMS1Q86VZ5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SGMS1Q86VZ5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SGMS1Q86VZ5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SGMS1Q86VZ5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SGMS1Q86VZ5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SGMS1Q86VZ5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SGMS1Q86VZ5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SGMS1Q86VZ5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SGMS1Q86VZ5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SGMS1Q86VZ5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SGMS1Q86VZ5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SGMS1Q86VZ5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SGMS1Q86VZ5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SGMS1Q86VZ5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SGMS1Q86VZ5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SGMS1Q86VZ5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SGMS1Q86VZ5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SGMS1Q86VZ5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SGMS1Q86VZ5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SGMS1Q86VZ5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SGMS1Q86VZ5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SGMS1Q86VZ5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SGMS1Q86VZ5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SGMS1Q86VZ5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SGMS1Q86VZ5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SGMS1Q86VZ5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SGMS1Q86VZ5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SGMS1Q86VZ5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SGMS1Q86VZ5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SGMS1Q86VZ5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SGMS1Q86VZ5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SGMS1Q86VZ5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SGMS1Q86VZ5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SGMS1Q86VZ5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SGMS1Q86VZ5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SGMS1Q86VZ5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SGMS1Q86VZ5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SGMS1Q86VZ5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SGMS1Q86VZ5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SGMS1Q86VZ5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SGMS1Q86VZ5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SGMS1Q86VZ5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SGMS1Q86VZ5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SGMS1Q86VZ5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SGMS1Q86VZ5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SGMS1Q86VZ5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SGMS1Q86VZ5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SGMS1Q86VZ5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SGMS1Q86VZ5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SGMS1Q86VZ5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SGMS1Q86VZ5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SGMS1Q86VZ5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SGMS1Q86VZ5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SGMS1Q86VZ5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SGMS1Q86VZ5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SGMS1Q86VZ5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SGMS1Q86VZ5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SGMS1Q86VZ5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SGMS1Q86VZ5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SGMS1Q86VZ5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SGMS1Q86VZ5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SGMS1Q86VZ5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SGMS1Q86VZ5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SGMS1Q86VZ5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SGMS1Q86VZ5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SGMS1Q86VZ5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SGMS1Q86VZ5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SGMS1Q86VZ5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SGMS1Q86VZ5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms