Protein–RNA interactions for Protein: Q86UA6

RPAIN, RPA-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAINQ86UA6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RPAINQ86UA6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RPAINQ86UA6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RPAINQ86UA6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RPAINQ86UA6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RPAINQ86UA6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RPAINQ86UA6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RPAINQ86UA6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
RPAINQ86UA6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPAINQ86UA6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPAINQ86UA6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPAINQ86UA6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPAINQ86UA6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPAINQ86UA6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPAINQ86UA6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPAINQ86UA6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPAINQ86UA6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RPAINQ86UA6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RPAINQ86UA6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RPAINQ86UA6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
RPAINQ86UA6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RPAINQ86UA6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RPAINQ86UA6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RPAINQ86UA6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RPAINQ86UA6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RPAINQ86UA6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RPAINQ86UA6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RPAINQ86UA6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RPAINQ86UA6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RPAINQ86UA6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RPAINQ86UA6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RPAINQ86UA6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RPAINQ86UA6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RPAINQ86UA6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RPAINQ86UA6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RPAINQ86UA6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RPAINQ86UA6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RPAINQ86UA6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RPAINQ86UA6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RPAINQ86UA6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RPAINQ86UA6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RPAINQ86UA6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RPAINQ86UA6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RPAINQ86UA6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RPAINQ86UA6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RPAINQ86UA6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RPAINQ86UA6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RPAINQ86UA6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RPAINQ86UA6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RPAINQ86UA6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RPAINQ86UA6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RPAINQ86UA6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RPAINQ86UA6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RPAINQ86UA6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RPAINQ86UA6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RPAINQ86UA6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RPAINQ86UA6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RPAINQ86UA6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RPAINQ86UA6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RPAINQ86UA6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RPAINQ86UA6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
RPAINQ86UA6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RPAINQ86UA6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RPAINQ86UA6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RPAINQ86UA6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
RPAINQ86UA6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RPAINQ86UA6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RPAINQ86UA6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RPAINQ86UA6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RPAINQ86UA6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RPAINQ86UA6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RPAINQ86UA6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RPAINQ86UA6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RPAINQ86UA6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RPAINQ86UA6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RPAINQ86UA6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RPAINQ86UA6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RPAINQ86UA6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RPAINQ86UA6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RPAINQ86UA6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RPAINQ86UA6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RPAINQ86UA6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RPAINQ86UA6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
RPAINQ86UA6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
RPAINQ86UA6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
RPAINQ86UA6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RPAINQ86UA6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RPAINQ86UA6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RPAINQ86UA6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RPAINQ86UA6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RPAINQ86UA6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
RPAINQ86UA6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RPAINQ86UA6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RPAINQ86UA6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RPAINQ86UA6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RPAINQ86UA6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RPAINQ86UA6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RPAINQ86UA6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RPAINQ86UA6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RPAINQ86UA6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.2 ms