Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z739

YTHDF3, YTH domain-containing family protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF3Q7Z739 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
YTHDF3Q7Z739 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
YTHDF3Q7Z739 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
YTHDF3Q7Z739 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
YTHDF3Q7Z739 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
YTHDF3Q7Z739 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
YTHDF3Q7Z739 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
YTHDF3Q7Z739 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
YTHDF3Q7Z739 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
YTHDF3Q7Z739 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
YTHDF3Q7Z739 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
YTHDF3Q7Z739 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
YTHDF3Q7Z739 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
YTHDF3Q7Z739 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
YTHDF3Q7Z739 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
YTHDF3Q7Z739 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
YTHDF3Q7Z739 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
YTHDF3Q7Z739 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
YTHDF3Q7Z739 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
YTHDF3Q7Z739 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
YTHDF3Q7Z739 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
YTHDF3Q7Z739 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
YTHDF3Q7Z739 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
YTHDF3Q7Z739 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
YTHDF3Q7Z739 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
YTHDF3Q7Z739 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
YTHDF3Q7Z739 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
YTHDF3Q7Z739 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
YTHDF3Q7Z739 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
YTHDF3Q7Z739 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
YTHDF3Q7Z739 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
YTHDF3Q7Z739 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
YTHDF3Q7Z739 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
YTHDF3Q7Z739 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
YTHDF3Q7Z739 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
YTHDF3Q7Z739 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
YTHDF3Q7Z739 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
YTHDF3Q7Z739 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
YTHDF3Q7Z739 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
YTHDF3Q7Z739 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
YTHDF3Q7Z739 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
YTHDF3Q7Z739 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
YTHDF3Q7Z739 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
YTHDF3Q7Z739 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
YTHDF3Q7Z739 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
YTHDF3Q7Z739 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
YTHDF3Q7Z739 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
YTHDF3Q7Z739 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
YTHDF3Q7Z739 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
YTHDF3Q7Z739 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
YTHDF3Q7Z739 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
YTHDF3Q7Z739 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
YTHDF3Q7Z739 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
YTHDF3Q7Z739 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
YTHDF3Q7Z739 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
YTHDF3Q7Z739 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
YTHDF3Q7Z739 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
YTHDF3Q7Z739 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
YTHDF3Q7Z739 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
YTHDF3Q7Z739 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
YTHDF3Q7Z739 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
YTHDF3Q7Z739 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
YTHDF3Q7Z739 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
YTHDF3Q7Z739 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
YTHDF3Q7Z739 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
YTHDF3Q7Z739 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
YTHDF3Q7Z739 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
YTHDF3Q7Z739 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
YTHDF3Q7Z739 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
YTHDF3Q7Z739 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
YTHDF3Q7Z739 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
YTHDF3Q7Z739 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
YTHDF3Q7Z739 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
YTHDF3Q7Z739 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
YTHDF3Q7Z739 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
YTHDF3Q7Z739 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
YTHDF3Q7Z739 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
YTHDF3Q7Z739 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
YTHDF3Q7Z739 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
YTHDF3Q7Z739 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
YTHDF3Q7Z739 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
YTHDF3Q7Z739 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
YTHDF3Q7Z739 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
YTHDF3Q7Z739 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
YTHDF3Q7Z739 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
YTHDF3Q7Z739 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
YTHDF3Q7Z739 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
YTHDF3Q7Z739 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
YTHDF3Q7Z739 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
YTHDF3Q7Z739 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
YTHDF3Q7Z739 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
YTHDF3Q7Z739 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
YTHDF3Q7Z739 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
YTHDF3Q7Z739 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
YTHDF3Q7Z739 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
YTHDF3Q7Z739 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
YTHDF3Q7Z739 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
YTHDF3Q7Z739 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
YTHDF3Q7Z739 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
YTHDF3Q7Z739 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms