Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4K8

TRIM46, Tripartite motif-containing protein 46, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM46Q7Z4K8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM46Q7Z4K8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM46Q7Z4K8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM46Q7Z4K8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM46Q7Z4K8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM46Q7Z4K8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM46Q7Z4K8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM46Q7Z4K8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM46Q7Z4K8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM46Q7Z4K8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM46Q7Z4K8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM46Q7Z4K8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM46Q7Z4K8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM46Q7Z4K8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM46Q7Z4K8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM46Q7Z4K8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM46Q7Z4K8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM46Q7Z4K8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM46Q7Z4K8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM46Q7Z4K8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM46Q7Z4K8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM46Q7Z4K8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM46Q7Z4K8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM46Q7Z4K8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM46Q7Z4K8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM46Q7Z4K8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM46Q7Z4K8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM46Q7Z4K8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM46Q7Z4K8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM46Q7Z4K8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM46Q7Z4K8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM46Q7Z4K8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM46Q7Z4K8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM46Q7Z4K8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM46Q7Z4K8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM46Q7Z4K8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM46Q7Z4K8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM46Q7Z4K8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM46Q7Z4K8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM46Q7Z4K8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM46Q7Z4K8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM46Q7Z4K8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM46Q7Z4K8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM46Q7Z4K8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM46Q7Z4K8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM46Q7Z4K8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM46Q7Z4K8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM46Q7Z4K8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM46Q7Z4K8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM46Q7Z4K8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM46Q7Z4K8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM46Q7Z4K8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM46Q7Z4K8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM46Q7Z4K8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM46Q7Z4K8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM46Q7Z4K8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM46Q7Z4K8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM46Q7Z4K8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM46Q7Z4K8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM46Q7Z4K8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM46Q7Z4K8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM46Q7Z4K8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM46Q7Z4K8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM46Q7Z4K8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM46Q7Z4K8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM46Q7Z4K8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM46Q7Z4K8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM46Q7Z4K8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM46Q7Z4K8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM46Q7Z4K8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM46Q7Z4K8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM46Q7Z4K8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM46Q7Z4K8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM46Q7Z4K8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM46Q7Z4K8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM46Q7Z4K8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM46Q7Z4K8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM46Q7Z4K8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM46Q7Z4K8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM46Q7Z4K8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM46Q7Z4K8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM46Q7Z4K8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM46Q7Z4K8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM46Q7Z4K8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM46Q7Z4K8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM46Q7Z4K8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM46Q7Z4K8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM46Q7Z4K8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM46Q7Z4K8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM46Q7Z4K8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM46Q7Z4K8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM46Q7Z4K8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM46Q7Z4K8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM46Q7Z4K8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM46Q7Z4K8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM46Q7Z4K8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM46Q7Z4K8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM46Q7Z4K8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM46Q7Z4K8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM46Q7Z4K8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 395.3 ms