Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT6

SSX6, Putative protein SSX6, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX6Q7RTT6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSX6Q7RTT6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSX6Q7RTT6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSX6Q7RTT6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSX6Q7RTT6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSX6Q7RTT6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSX6Q7RTT6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
SSX6Q7RTT6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSX6Q7RTT6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSX6Q7RTT6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSX6Q7RTT6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSX6Q7RTT6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSX6Q7RTT6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSX6Q7RTT6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSX6Q7RTT6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSX6Q7RTT6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSX6Q7RTT6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSX6Q7RTT6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSX6Q7RTT6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSX6Q7RTT6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSX6Q7RTT6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SSX6Q7RTT6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSX6Q7RTT6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSX6Q7RTT6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSX6Q7RTT6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSX6Q7RTT6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSX6Q7RTT6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SSX6Q7RTT6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SSX6Q7RTT6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSX6Q7RTT6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSX6Q7RTT6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSX6Q7RTT6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSX6Q7RTT6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSX6Q7RTT6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSX6Q7RTT6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSX6Q7RTT6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSX6Q7RTT6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSX6Q7RTT6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSX6Q7RTT6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSX6Q7RTT6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSX6Q7RTT6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSX6Q7RTT6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSX6Q7RTT6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSX6Q7RTT6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSX6Q7RTT6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSX6Q7RTT6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SSX6Q7RTT6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSX6Q7RTT6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSX6Q7RTT6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSX6Q7RTT6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSX6Q7RTT6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSX6Q7RTT6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSX6Q7RTT6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSX6Q7RTT6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSX6Q7RTT6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSX6Q7RTT6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSX6Q7RTT6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSX6Q7RTT6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SSX6Q7RTT6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSX6Q7RTT6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSX6Q7RTT6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSX6Q7RTT6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SSX6Q7RTT6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SSX6Q7RTT6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SSX6Q7RTT6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SSX6Q7RTT6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SSX6Q7RTT6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SSX6Q7RTT6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SSX6Q7RTT6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SSX6Q7RTT6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SSX6Q7RTT6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SSX6Q7RTT6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SSX6Q7RTT6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSX6Q7RTT6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSX6Q7RTT6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSX6Q7RTT6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSX6Q7RTT6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSX6Q7RTT6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSX6Q7RTT6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSX6Q7RTT6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSX6Q7RTT6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSX6Q7RTT6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSX6Q7RTT6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSX6Q7RTT6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSX6Q7RTT6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSX6Q7RTT6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSX6Q7RTT6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSX6Q7RTT6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSX6Q7RTT6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSX6Q7RTT6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSX6Q7RTT6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSX6Q7RTT6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSX6Q7RTT6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSX6Q7RTT6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSX6Q7RTT6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSX6Q7RTT6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSX6Q7RTT6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SSX6Q7RTT6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSX6Q7RTT6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSX6Q7RTT6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms