Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

Predictions only

Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP43Q70EL4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP43Q70EL4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP43Q70EL4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP43Q70EL4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP43Q70EL4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP43Q70EL4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP43Q70EL4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP43Q70EL4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP43Q70EL4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP43Q70EL4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP43Q70EL4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
USP43Q70EL4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
USP43Q70EL4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP43Q70EL4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP43Q70EL4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP43Q70EL4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP43Q70EL4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP43Q70EL4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP43Q70EL4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP43Q70EL4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP43Q70EL4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP43Q70EL4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP43Q70EL4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP43Q70EL4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP43Q70EL4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP43Q70EL4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP43Q70EL4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP43Q70EL4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP43Q70EL4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP43Q70EL4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP43Q70EL4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP43Q70EL4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP43Q70EL4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP43Q70EL4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP43Q70EL4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP43Q70EL4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP43Q70EL4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP43Q70EL4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP43Q70EL4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
USP43Q70EL4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
USP43Q70EL4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP43Q70EL4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP43Q70EL4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP43Q70EL4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP43Q70EL4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP43Q70EL4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP43Q70EL4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP43Q70EL4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP43Q70EL4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP43Q70EL4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP43Q70EL4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP43Q70EL4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP43Q70EL4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP43Q70EL4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP43Q70EL4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP43Q70EL4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP43Q70EL4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP43Q70EL4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP43Q70EL4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP43Q70EL4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP43Q70EL4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
USP43Q70EL4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP43Q70EL4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP43Q70EL4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP43Q70EL4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP43Q70EL4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP43Q70EL4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP43Q70EL4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP43Q70EL4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP43Q70EL4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP43Q70EL4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP43Q70EL4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP43Q70EL4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP43Q70EL4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP43Q70EL4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP43Q70EL4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP43Q70EL4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP43Q70EL4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP43Q70EL4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP43Q70EL4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP43Q70EL4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP43Q70EL4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
USP43Q70EL4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP43Q70EL4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP43Q70EL4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP43Q70EL4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP43Q70EL4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP43Q70EL4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP43Q70EL4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP43Q70EL4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
USP43Q70EL4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP43Q70EL4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP43Q70EL4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP43Q70EL4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP43Q70EL4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP43Q70EL4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP43Q70EL4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP43Q70EL4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP43Q70EL4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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