Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

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Length 1,888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
UBR3Q6ZT12 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
UBR3Q6ZT12 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
UBR3Q6ZT12 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
UBR3Q6ZT12 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
UBR3Q6ZT12 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
UBR3Q6ZT12 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
UBR3Q6ZT12 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
UBR3Q6ZT12 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
UBR3Q6ZT12 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
UBR3Q6ZT12 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
UBR3Q6ZT12 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
UBR3Q6ZT12 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
UBR3Q6ZT12 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
UBR3Q6ZT12 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
UBR3Q6ZT12 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
UBR3Q6ZT12 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
UBR3Q6ZT12 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
UBR3Q6ZT12 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
UBR3Q6ZT12 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
UBR3Q6ZT12 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
UBR3Q6ZT12 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
UBR3Q6ZT12 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
UBR3Q6ZT12 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
UBR3Q6ZT12 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
UBR3Q6ZT12 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.66■■■□□ 2.5
UBR3Q6ZT12 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.66■■■□□ 2.5
UBR3Q6ZT12 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
UBR3Q6ZT12 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
UBR3Q6ZT12 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
UBR3Q6ZT12 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
UBR3Q6ZT12 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
UBR3Q6ZT12 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
UBR3Q6ZT12 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
UBR3Q6ZT12 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
UBR3Q6ZT12 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
UBR3Q6ZT12 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
UBR3Q6ZT12 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
UBR3Q6ZT12 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
UBR3Q6ZT12 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
UBR3Q6ZT12 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
UBR3Q6ZT12 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
UBR3Q6ZT12 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
UBR3Q6ZT12 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
UBR3Q6ZT12 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
UBR3Q6ZT12 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
UBR3Q6ZT12 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
UBR3Q6ZT12 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
UBR3Q6ZT12 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
UBR3Q6ZT12 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC30.61■■■□□ 2.49
UBR3Q6ZT12 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
UBR3Q6ZT12 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
UBR3Q6ZT12 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
UBR3Q6ZT12 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
UBR3Q6ZT12 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
UBR3Q6ZT12 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
UBR3Q6ZT12 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
UBR3Q6ZT12 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
UBR3Q6ZT12 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
UBR3Q6ZT12 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC30.6■■■□□ 2.49
UBR3Q6ZT12 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
UBR3Q6ZT12 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
UBR3Q6ZT12 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
UBR3Q6ZT12 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
UBR3Q6ZT12 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
UBR3Q6ZT12 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
UBR3Q6ZT12 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
UBR3Q6ZT12 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
UBR3Q6ZT12 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
UBR3Q6ZT12 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
UBR3Q6ZT12 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
UBR3Q6ZT12 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
UBR3Q6ZT12 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
UBR3Q6ZT12 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
UBR3Q6ZT12 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
UBR3Q6ZT12 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
UBR3Q6ZT12 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
UBR3Q6ZT12 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
UBR3Q6ZT12 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
UBR3Q6ZT12 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
UBR3Q6ZT12 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
UBR3Q6ZT12 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
UBR3Q6ZT12 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
UBR3Q6ZT12 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
UBR3Q6ZT12 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
UBR3Q6ZT12 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
UBR3Q6ZT12 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
UBR3Q6ZT12 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
UBR3Q6ZT12 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
UBR3Q6ZT12 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
UBR3Q6ZT12 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC30.52■■■□□ 2.48
UBR3Q6ZT12 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
UBR3Q6ZT12 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
UBR3Q6ZT12 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
UBR3Q6ZT12 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
UBR3Q6ZT12 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
UBR3Q6ZT12 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
UBR3Q6ZT12 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
UBR3Q6ZT12 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
UBR3Q6ZT12 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
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