Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZS17

RIPOR1, Rho family-interacting cell polarization regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPOR1Q6ZS17 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIPOR1Q6ZS17 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIPOR1Q6ZS17 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIPOR1Q6ZS17 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIPOR1Q6ZS17 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIPOR1Q6ZS17 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIPOR1Q6ZS17 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIPOR1Q6ZS17 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIPOR1Q6ZS17 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIPOR1Q6ZS17 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIPOR1Q6ZS17 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIPOR1Q6ZS17 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIPOR1Q6ZS17 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIPOR1Q6ZS17 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIPOR1Q6ZS17 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIPOR1Q6ZS17 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIPOR1Q6ZS17 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIPOR1Q6ZS17 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RIPOR1Q6ZS17 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIPOR1Q6ZS17 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RIPOR1Q6ZS17 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIPOR1Q6ZS17 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIPOR1Q6ZS17 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RIPOR1Q6ZS17 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RIPOR1Q6ZS17 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIPOR1Q6ZS17 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIPOR1Q6ZS17 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIPOR1Q6ZS17 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIPOR1Q6ZS17 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIPOR1Q6ZS17 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIPOR1Q6ZS17 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIPOR1Q6ZS17 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIPOR1Q6ZS17 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIPOR1Q6ZS17 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIPOR1Q6ZS17 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIPOR1Q6ZS17 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIPOR1Q6ZS17 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIPOR1Q6ZS17 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIPOR1Q6ZS17 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIPOR1Q6ZS17 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RIPOR1Q6ZS17 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIPOR1Q6ZS17 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIPOR1Q6ZS17 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIPOR1Q6ZS17 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIPOR1Q6ZS17 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RIPOR1Q6ZS17 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIPOR1Q6ZS17 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RIPOR1Q6ZS17 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIPOR1Q6ZS17 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIPOR1Q6ZS17 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RIPOR1Q6ZS17 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIPOR1Q6ZS17 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIPOR1Q6ZS17 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIPOR1Q6ZS17 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIPOR1Q6ZS17 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIPOR1Q6ZS17 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIPOR1Q6ZS17 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIPOR1Q6ZS17 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIPOR1Q6ZS17 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIPOR1Q6ZS17 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIPOR1Q6ZS17 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIPOR1Q6ZS17 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIPOR1Q6ZS17 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIPOR1Q6ZS17 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIPOR1Q6ZS17 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIPOR1Q6ZS17 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIPOR1Q6ZS17 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIPOR1Q6ZS17 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIPOR1Q6ZS17 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIPOR1Q6ZS17 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RIPOR1Q6ZS17 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIPOR1Q6ZS17 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RIPOR1Q6ZS17 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RIPOR1Q6ZS17 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RIPOR1Q6ZS17 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RIPOR1Q6ZS17 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RIPOR1Q6ZS17 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RIPOR1Q6ZS17 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIPOR1Q6ZS17 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIPOR1Q6ZS17 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIPOR1Q6ZS17 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIPOR1Q6ZS17 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIPOR1Q6ZS17 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIPOR1Q6ZS17 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIPOR1Q6ZS17 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RIPOR1Q6ZS17 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RIPOR1Q6ZS17 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RIPOR1Q6ZS17 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RIPOR1Q6ZS17 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RIPOR1Q6ZS17 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RIPOR1Q6ZS17 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RIPOR1Q6ZS17 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RIPOR1Q6ZS17 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RIPOR1Q6ZS17 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RIPOR1Q6ZS17 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RIPOR1Q6ZS17 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RIPOR1Q6ZS17 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RIPOR1Q6ZS17 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIPOR1Q6ZS17 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIPOR1Q6ZS17 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms