Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXS9

CASP12, Inactive caspase-12, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP12Q6UXS9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP12Q6UXS9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP12Q6UXS9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP12Q6UXS9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP12Q6UXS9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP12Q6UXS9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP12Q6UXS9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP12Q6UXS9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP12Q6UXS9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP12Q6UXS9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP12Q6UXS9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP12Q6UXS9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP12Q6UXS9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP12Q6UXS9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP12Q6UXS9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP12Q6UXS9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP12Q6UXS9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP12Q6UXS9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP12Q6UXS9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP12Q6UXS9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP12Q6UXS9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP12Q6UXS9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASP12Q6UXS9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASP12Q6UXS9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASP12Q6UXS9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASP12Q6UXS9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASP12Q6UXS9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CASP12Q6UXS9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASP12Q6UXS9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CASP12Q6UXS9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASP12Q6UXS9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASP12Q6UXS9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASP12Q6UXS9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASP12Q6UXS9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CASP12Q6UXS9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASP12Q6UXS9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASP12Q6UXS9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASP12Q6UXS9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASP12Q6UXS9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASP12Q6UXS9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASP12Q6UXS9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASP12Q6UXS9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASP12Q6UXS9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CASP12Q6UXS9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CASP12Q6UXS9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CASP12Q6UXS9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CASP12Q6UXS9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CASP12Q6UXS9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CASP12Q6UXS9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP12Q6UXS9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP12Q6UXS9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP12Q6UXS9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP12Q6UXS9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP12Q6UXS9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP12Q6UXS9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP12Q6UXS9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP12Q6UXS9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASP12Q6UXS9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASP12Q6UXS9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASP12Q6UXS9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASP12Q6UXS9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASP12Q6UXS9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASP12Q6UXS9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASP12Q6UXS9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP12Q6UXS9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP12Q6UXS9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP12Q6UXS9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP12Q6UXS9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP12Q6UXS9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP12Q6UXS9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CASP12Q6UXS9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CASP12Q6UXS9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CASP12Q6UXS9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CASP12Q6UXS9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CASP12Q6UXS9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CASP12Q6UXS9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CASP12Q6UXS9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CASP12Q6UXS9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CASP12Q6UXS9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CASP12Q6UXS9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CASP12Q6UXS9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP12Q6UXS9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP12Q6UXS9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP12Q6UXS9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP12Q6UXS9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP12Q6UXS9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP12Q6UXS9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP12Q6UXS9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP12Q6UXS9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP12Q6UXS9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP12Q6UXS9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP12Q6UXS9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP12Q6UXS9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP12Q6UXS9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP12Q6UXS9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP12Q6UXS9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP12Q6UXS9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP12Q6UXS9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP12Q6UXS9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP12Q6UXS9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms