Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRIG3Q6UXM1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRIG3Q6UXM1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRIG3Q6UXM1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
LRIG3Q6UXM1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRIG3Q6UXM1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRIG3Q6UXM1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRIG3Q6UXM1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRIG3Q6UXM1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRIG3Q6UXM1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRIG3Q6UXM1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRIG3Q6UXM1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRIG3Q6UXM1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRIG3Q6UXM1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRIG3Q6UXM1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRIG3Q6UXM1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRIG3Q6UXM1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LRIG3Q6UXM1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRIG3Q6UXM1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRIG3Q6UXM1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRIG3Q6UXM1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRIG3Q6UXM1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRIG3Q6UXM1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRIG3Q6UXM1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRIG3Q6UXM1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRIG3Q6UXM1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRIG3Q6UXM1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRIG3Q6UXM1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRIG3Q6UXM1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRIG3Q6UXM1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRIG3Q6UXM1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRIG3Q6UXM1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRIG3Q6UXM1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRIG3Q6UXM1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRIG3Q6UXM1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LRIG3Q6UXM1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRIG3Q6UXM1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRIG3Q6UXM1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRIG3Q6UXM1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRIG3Q6UXM1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRIG3Q6UXM1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRIG3Q6UXM1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRIG3Q6UXM1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRIG3Q6UXM1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRIG3Q6UXM1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRIG3Q6UXM1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRIG3Q6UXM1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRIG3Q6UXM1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRIG3Q6UXM1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRIG3Q6UXM1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRIG3Q6UXM1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LRIG3Q6UXM1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRIG3Q6UXM1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRIG3Q6UXM1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRIG3Q6UXM1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRIG3Q6UXM1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRIG3Q6UXM1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRIG3Q6UXM1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRIG3Q6UXM1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRIG3Q6UXM1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRIG3Q6UXM1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRIG3Q6UXM1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRIG3Q6UXM1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRIG3Q6UXM1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRIG3Q6UXM1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRIG3Q6UXM1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRIG3Q6UXM1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRIG3Q6UXM1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRIG3Q6UXM1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRIG3Q6UXM1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRIG3Q6UXM1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRIG3Q6UXM1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRIG3Q6UXM1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRIG3Q6UXM1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRIG3Q6UXM1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRIG3Q6UXM1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRIG3Q6UXM1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRIG3Q6UXM1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRIG3Q6UXM1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRIG3Q6UXM1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRIG3Q6UXM1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRIG3Q6UXM1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRIG3Q6UXM1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRIG3Q6UXM1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRIG3Q6UXM1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRIG3Q6UXM1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRIG3Q6UXM1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LRIG3Q6UXM1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRIG3Q6UXM1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRIG3Q6UXM1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRIG3Q6UXM1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRIG3Q6UXM1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRIG3Q6UXM1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRIG3Q6UXM1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRIG3Q6UXM1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRIG3Q6UXM1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRIG3Q6UXM1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRIG3Q6UXM1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRIG3Q6UXM1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRIG3Q6UXM1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 939 ms