Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWN0

LYPD4, Ly6/PLAUR domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYPD4Q6UWN0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LYPD4Q6UWN0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LYPD4Q6UWN0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LYPD4Q6UWN0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LYPD4Q6UWN0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
LYPD4Q6UWN0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LYPD4Q6UWN0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LYPD4Q6UWN0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LYPD4Q6UWN0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LYPD4Q6UWN0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LYPD4Q6UWN0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LYPD4Q6UWN0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LYPD4Q6UWN0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LYPD4Q6UWN0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LYPD4Q6UWN0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LYPD4Q6UWN0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LYPD4Q6UWN0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LYPD4Q6UWN0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LYPD4Q6UWN0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LYPD4Q6UWN0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LYPD4Q6UWN0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LYPD4Q6UWN0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LYPD4Q6UWN0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LYPD4Q6UWN0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LYPD4Q6UWN0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LYPD4Q6UWN0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LYPD4Q6UWN0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LYPD4Q6UWN0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LYPD4Q6UWN0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LYPD4Q6UWN0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LYPD4Q6UWN0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LYPD4Q6UWN0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LYPD4Q6UWN0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LYPD4Q6UWN0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LYPD4Q6UWN0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LYPD4Q6UWN0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LYPD4Q6UWN0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LYPD4Q6UWN0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LYPD4Q6UWN0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LYPD4Q6UWN0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LYPD4Q6UWN0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LYPD4Q6UWN0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
LYPD4Q6UWN0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LYPD4Q6UWN0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LYPD4Q6UWN0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LYPD4Q6UWN0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LYPD4Q6UWN0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LYPD4Q6UWN0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LYPD4Q6UWN0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LYPD4Q6UWN0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LYPD4Q6UWN0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LYPD4Q6UWN0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LYPD4Q6UWN0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LYPD4Q6UWN0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LYPD4Q6UWN0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LYPD4Q6UWN0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LYPD4Q6UWN0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LYPD4Q6UWN0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LYPD4Q6UWN0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LYPD4Q6UWN0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LYPD4Q6UWN0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LYPD4Q6UWN0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LYPD4Q6UWN0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LYPD4Q6UWN0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LYPD4Q6UWN0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LYPD4Q6UWN0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LYPD4Q6UWN0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LYPD4Q6UWN0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LYPD4Q6UWN0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LYPD4Q6UWN0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LYPD4Q6UWN0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LYPD4Q6UWN0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LYPD4Q6UWN0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LYPD4Q6UWN0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LYPD4Q6UWN0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LYPD4Q6UWN0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LYPD4Q6UWN0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LYPD4Q6UWN0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LYPD4Q6UWN0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LYPD4Q6UWN0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LYPD4Q6UWN0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LYPD4Q6UWN0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LYPD4Q6UWN0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LYPD4Q6UWN0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LYPD4Q6UWN0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LYPD4Q6UWN0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LYPD4Q6UWN0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LYPD4Q6UWN0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LYPD4Q6UWN0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LYPD4Q6UWN0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LYPD4Q6UWN0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LYPD4Q6UWN0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LYPD4Q6UWN0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
LYPD4Q6UWN0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LYPD4Q6UWN0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LYPD4Q6UWN0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LYPD4Q6UWN0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
LYPD4Q6UWN0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LYPD4Q6UWN0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LYPD4Q6UWN0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms