Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWJ1

TMCO3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 677 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO3Q6UWJ1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMCO3Q6UWJ1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMCO3Q6UWJ1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMCO3Q6UWJ1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMCO3Q6UWJ1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMCO3Q6UWJ1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMCO3Q6UWJ1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TMCO3Q6UWJ1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMCO3Q6UWJ1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMCO3Q6UWJ1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMCO3Q6UWJ1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMCO3Q6UWJ1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMCO3Q6UWJ1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMCO3Q6UWJ1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMCO3Q6UWJ1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMCO3Q6UWJ1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMCO3Q6UWJ1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMCO3Q6UWJ1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMCO3Q6UWJ1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMCO3Q6UWJ1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMCO3Q6UWJ1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMCO3Q6UWJ1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMCO3Q6UWJ1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMCO3Q6UWJ1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMCO3Q6UWJ1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMCO3Q6UWJ1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMCO3Q6UWJ1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMCO3Q6UWJ1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMCO3Q6UWJ1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMCO3Q6UWJ1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMCO3Q6UWJ1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMCO3Q6UWJ1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMCO3Q6UWJ1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMCO3Q6UWJ1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TMCO3Q6UWJ1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMCO3Q6UWJ1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMCO3Q6UWJ1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TMCO3Q6UWJ1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMCO3Q6UWJ1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMCO3Q6UWJ1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMCO3Q6UWJ1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMCO3Q6UWJ1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMCO3Q6UWJ1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMCO3Q6UWJ1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMCO3Q6UWJ1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMCO3Q6UWJ1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMCO3Q6UWJ1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMCO3Q6UWJ1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMCO3Q6UWJ1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMCO3Q6UWJ1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMCO3Q6UWJ1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMCO3Q6UWJ1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMCO3Q6UWJ1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TMCO3Q6UWJ1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMCO3Q6UWJ1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMCO3Q6UWJ1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMCO3Q6UWJ1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMCO3Q6UWJ1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMCO3Q6UWJ1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMCO3Q6UWJ1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMCO3Q6UWJ1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TMCO3Q6UWJ1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMCO3Q6UWJ1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMCO3Q6UWJ1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMCO3Q6UWJ1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMCO3Q6UWJ1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMCO3Q6UWJ1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMCO3Q6UWJ1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMCO3Q6UWJ1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMCO3Q6UWJ1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMCO3Q6UWJ1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMCO3Q6UWJ1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMCO3Q6UWJ1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMCO3Q6UWJ1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMCO3Q6UWJ1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMCO3Q6UWJ1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMCO3Q6UWJ1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMCO3Q6UWJ1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMCO3Q6UWJ1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMCO3Q6UWJ1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMCO3Q6UWJ1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMCO3Q6UWJ1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMCO3Q6UWJ1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMCO3Q6UWJ1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMCO3Q6UWJ1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMCO3Q6UWJ1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMCO3Q6UWJ1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMCO3Q6UWJ1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMCO3Q6UWJ1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TMCO3Q6UWJ1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMCO3Q6UWJ1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMCO3Q6UWJ1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMCO3Q6UWJ1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMCO3Q6UWJ1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMCO3Q6UWJ1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMCO3Q6UWJ1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMCO3Q6UWJ1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMCO3Q6UWJ1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMCO3Q6UWJ1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMCO3Q6UWJ1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
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