Protein–RNA interactions for Protein: Q6UN15

FIP1L1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FIP1L1Q6UN15 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FIP1L1Q6UN15 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FIP1L1Q6UN15 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FIP1L1Q6UN15 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FIP1L1Q6UN15 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FIP1L1Q6UN15 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FIP1L1Q6UN15 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FIP1L1Q6UN15 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FIP1L1Q6UN15 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FIP1L1Q6UN15 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FIP1L1Q6UN15 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FIP1L1Q6UN15 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FIP1L1Q6UN15 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FIP1L1Q6UN15 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FIP1L1Q6UN15 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FIP1L1Q6UN15 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FIP1L1Q6UN15 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FIP1L1Q6UN15 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FIP1L1Q6UN15 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
FIP1L1Q6UN15 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
FIP1L1Q6UN15 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FIP1L1Q6UN15 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
FIP1L1Q6UN15 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FIP1L1Q6UN15 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FIP1L1Q6UN15 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FIP1L1Q6UN15 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FIP1L1Q6UN15 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FIP1L1Q6UN15 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FIP1L1Q6UN15 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FIP1L1Q6UN15 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FIP1L1Q6UN15 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
FIP1L1Q6UN15 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FIP1L1Q6UN15 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FIP1L1Q6UN15 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FIP1L1Q6UN15 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FIP1L1Q6UN15 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FIP1L1Q6UN15 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FIP1L1Q6UN15 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FIP1L1Q6UN15 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FIP1L1Q6UN15 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FIP1L1Q6UN15 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FIP1L1Q6UN15 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FIP1L1Q6UN15 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FIP1L1Q6UN15 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FIP1L1Q6UN15 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FIP1L1Q6UN15 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FIP1L1Q6UN15 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FIP1L1Q6UN15 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FIP1L1Q6UN15 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FIP1L1Q6UN15 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FIP1L1Q6UN15 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
FIP1L1Q6UN15 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FIP1L1Q6UN15 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FIP1L1Q6UN15 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FIP1L1Q6UN15 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FIP1L1Q6UN15 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FIP1L1Q6UN15 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FIP1L1Q6UN15 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FIP1L1Q6UN15 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FIP1L1Q6UN15 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FIP1L1Q6UN15 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FIP1L1Q6UN15 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FIP1L1Q6UN15 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FIP1L1Q6UN15 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FIP1L1Q6UN15 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FIP1L1Q6UN15 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FIP1L1Q6UN15 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FIP1L1Q6UN15 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FIP1L1Q6UN15 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FIP1L1Q6UN15 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FIP1L1Q6UN15 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FIP1L1Q6UN15 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FIP1L1Q6UN15 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FIP1L1Q6UN15 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FIP1L1Q6UN15 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FIP1L1Q6UN15 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FIP1L1Q6UN15 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FIP1L1Q6UN15 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
FIP1L1Q6UN15 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FIP1L1Q6UN15 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FIP1L1Q6UN15 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FIP1L1Q6UN15 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FIP1L1Q6UN15 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FIP1L1Q6UN15 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FIP1L1Q6UN15 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FIP1L1Q6UN15 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FIP1L1Q6UN15 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FIP1L1Q6UN15 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FIP1L1Q6UN15 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FIP1L1Q6UN15 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FIP1L1Q6UN15 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FIP1L1Q6UN15 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FIP1L1Q6UN15 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
FIP1L1Q6UN15 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FIP1L1Q6UN15 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FIP1L1Q6UN15 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FIP1L1Q6UN15 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
FIP1L1Q6UN15 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FIP1L1Q6UN15 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FIP1L1Q6UN15 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms