Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEW1

ZCCHC12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC12Q6PEW1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZCCHC12Q6PEW1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZCCHC12Q6PEW1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZCCHC12Q6PEW1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZCCHC12Q6PEW1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZCCHC12Q6PEW1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZCCHC12Q6PEW1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZCCHC12Q6PEW1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ZCCHC12Q6PEW1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZCCHC12Q6PEW1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZCCHC12Q6PEW1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZCCHC12Q6PEW1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ZCCHC12Q6PEW1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZCCHC12Q6PEW1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ZCCHC12Q6PEW1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZCCHC12Q6PEW1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZCCHC12Q6PEW1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZCCHC12Q6PEW1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZCCHC12Q6PEW1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZCCHC12Q6PEW1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ZCCHC12Q6PEW1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ZCCHC12Q6PEW1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ZCCHC12Q6PEW1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZCCHC12Q6PEW1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZCCHC12Q6PEW1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZCCHC12Q6PEW1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZCCHC12Q6PEW1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZCCHC12Q6PEW1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZCCHC12Q6PEW1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZCCHC12Q6PEW1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZCCHC12Q6PEW1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZCCHC12Q6PEW1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZCCHC12Q6PEW1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZCCHC12Q6PEW1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZCCHC12Q6PEW1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZCCHC12Q6PEW1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZCCHC12Q6PEW1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZCCHC12Q6PEW1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZCCHC12Q6PEW1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZCCHC12Q6PEW1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZCCHC12Q6PEW1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZCCHC12Q6PEW1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZCCHC12Q6PEW1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZCCHC12Q6PEW1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZCCHC12Q6PEW1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZCCHC12Q6PEW1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZCCHC12Q6PEW1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZCCHC12Q6PEW1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZCCHC12Q6PEW1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZCCHC12Q6PEW1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZCCHC12Q6PEW1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZCCHC12Q6PEW1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZCCHC12Q6PEW1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZCCHC12Q6PEW1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZCCHC12Q6PEW1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZCCHC12Q6PEW1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZCCHC12Q6PEW1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZCCHC12Q6PEW1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZCCHC12Q6PEW1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZCCHC12Q6PEW1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZCCHC12Q6PEW1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZCCHC12Q6PEW1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZCCHC12Q6PEW1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZCCHC12Q6PEW1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZCCHC12Q6PEW1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZCCHC12Q6PEW1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZCCHC12Q6PEW1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZCCHC12Q6PEW1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZCCHC12Q6PEW1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZCCHC12Q6PEW1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZCCHC12Q6PEW1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZCCHC12Q6PEW1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZCCHC12Q6PEW1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZCCHC12Q6PEW1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZCCHC12Q6PEW1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZCCHC12Q6PEW1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ZCCHC12Q6PEW1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZCCHC12Q6PEW1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZCCHC12Q6PEW1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ZCCHC12Q6PEW1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZCCHC12Q6PEW1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZCCHC12Q6PEW1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZCCHC12Q6PEW1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZCCHC12Q6PEW1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZCCHC12Q6PEW1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZCCHC12Q6PEW1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZCCHC12Q6PEW1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZCCHC12Q6PEW1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZCCHC12Q6PEW1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZCCHC12Q6PEW1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZCCHC12Q6PEW1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZCCHC12Q6PEW1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZCCHC12Q6PEW1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ZCCHC12Q6PEW1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZCCHC12Q6PEW1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZCCHC12Q6PEW1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZCCHC12Q6PEW1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms