Protein–RNA interactions for Protein: Q6NYC8

PPP1R18, Phostensin, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R18Q6NYC8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PPP1R18Q6NYC8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PPP1R18Q6NYC8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PPP1R18Q6NYC8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PPP1R18Q6NYC8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PPP1R18Q6NYC8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PPP1R18Q6NYC8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PPP1R18Q6NYC8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PPP1R18Q6NYC8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PPP1R18Q6NYC8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPP1R18Q6NYC8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPP1R18Q6NYC8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPP1R18Q6NYC8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPP1R18Q6NYC8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPP1R18Q6NYC8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPP1R18Q6NYC8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPP1R18Q6NYC8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPP1R18Q6NYC8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PPP1R18Q6NYC8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PPP1R18Q6NYC8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PPP1R18Q6NYC8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PPP1R18Q6NYC8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PPP1R18Q6NYC8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PPP1R18Q6NYC8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PPP1R18Q6NYC8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PPP1R18Q6NYC8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PPP1R18Q6NYC8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PPP1R18Q6NYC8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PPP1R18Q6NYC8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PPP1R18Q6NYC8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PPP1R18Q6NYC8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PPP1R18Q6NYC8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PPP1R18Q6NYC8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PPP1R18Q6NYC8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PPP1R18Q6NYC8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PPP1R18Q6NYC8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PPP1R18Q6NYC8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PPP1R18Q6NYC8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PPP1R18Q6NYC8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PPP1R18Q6NYC8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PPP1R18Q6NYC8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PPP1R18Q6NYC8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PPP1R18Q6NYC8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PPP1R18Q6NYC8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PPP1R18Q6NYC8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PPP1R18Q6NYC8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PPP1R18Q6NYC8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PPP1R18Q6NYC8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PPP1R18Q6NYC8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PPP1R18Q6NYC8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PPP1R18Q6NYC8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PPP1R18Q6NYC8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PPP1R18Q6NYC8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PPP1R18Q6NYC8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PPP1R18Q6NYC8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PPP1R18Q6NYC8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PPP1R18Q6NYC8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PPP1R18Q6NYC8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PPP1R18Q6NYC8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PPP1R18Q6NYC8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PPP1R18Q6NYC8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PPP1R18Q6NYC8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PPP1R18Q6NYC8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PPP1R18Q6NYC8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PPP1R18Q6NYC8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PPP1R18Q6NYC8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PPP1R18Q6NYC8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PPP1R18Q6NYC8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PPP1R18Q6NYC8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPP1R18Q6NYC8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PPP1R18Q6NYC8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPP1R18Q6NYC8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPP1R18Q6NYC8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPP1R18Q6NYC8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PPP1R18Q6NYC8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PPP1R18Q6NYC8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PPP1R18Q6NYC8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PPP1R18Q6NYC8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PPP1R18Q6NYC8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
PPP1R18Q6NYC8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPP1R18Q6NYC8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPP1R18Q6NYC8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPP1R18Q6NYC8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PPP1R18Q6NYC8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PPP1R18Q6NYC8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PPP1R18Q6NYC8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PPP1R18Q6NYC8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PPP1R18Q6NYC8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PPP1R18Q6NYC8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PPP1R18Q6NYC8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PPP1R18Q6NYC8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PPP1R18Q6NYC8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PPP1R18Q6NYC8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PPP1R18Q6NYC8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PPP1R18Q6NYC8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PPP1R18Q6NYC8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PPP1R18Q6NYC8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PPP1R18Q6NYC8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PPP1R18Q6NYC8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PPP1R18Q6NYC8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms