Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRNP1Q6NT89 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRNP1Q6NT89 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRNP1Q6NT89 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRNP1Q6NT89 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRNP1Q6NT89 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRNP1Q6NT89 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRNP1Q6NT89 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRNP1Q6NT89 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRNP1Q6NT89 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRNP1Q6NT89 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRNP1Q6NT89 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TRNP1Q6NT89 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRNP1Q6NT89 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TRNP1Q6NT89 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRNP1Q6NT89 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRNP1Q6NT89 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRNP1Q6NT89 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TRNP1Q6NT89 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TRNP1Q6NT89 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TRNP1Q6NT89 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRNP1Q6NT89 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRNP1Q6NT89 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRNP1Q6NT89 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRNP1Q6NT89 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRNP1Q6NT89 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRNP1Q6NT89 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRNP1Q6NT89 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRNP1Q6NT89 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRNP1Q6NT89 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRNP1Q6NT89 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRNP1Q6NT89 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRNP1Q6NT89 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRNP1Q6NT89 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRNP1Q6NT89 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TRNP1Q6NT89 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TRNP1Q6NT89 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRNP1Q6NT89 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRNP1Q6NT89 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRNP1Q6NT89 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRNP1Q6NT89 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRNP1Q6NT89 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRNP1Q6NT89 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRNP1Q6NT89 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRNP1Q6NT89 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRNP1Q6NT89 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRNP1Q6NT89 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRNP1Q6NT89 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRNP1Q6NT89 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRNP1Q6NT89 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRNP1Q6NT89 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRNP1Q6NT89 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRNP1Q6NT89 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRNP1Q6NT89 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRNP1Q6NT89 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRNP1Q6NT89 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRNP1Q6NT89 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRNP1Q6NT89 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRNP1Q6NT89 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRNP1Q6NT89 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRNP1Q6NT89 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRNP1Q6NT89 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRNP1Q6NT89 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRNP1Q6NT89 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRNP1Q6NT89 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRNP1Q6NT89 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TRNP1Q6NT89 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRNP1Q6NT89 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRNP1Q6NT89 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRNP1Q6NT89 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRNP1Q6NT89 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRNP1Q6NT89 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRNP1Q6NT89 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRNP1Q6NT89 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRNP1Q6NT89 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRNP1Q6NT89 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRNP1Q6NT89 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRNP1Q6NT89 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRNP1Q6NT89 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRNP1Q6NT89 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRNP1Q6NT89 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRNP1Q6NT89 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRNP1Q6NT89 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TRNP1Q6NT89 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TRNP1Q6NT89 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRNP1Q6NT89 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRNP1Q6NT89 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRNP1Q6NT89 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRNP1Q6NT89 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRNP1Q6NT89 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRNP1Q6NT89 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRNP1Q6NT89 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRNP1Q6NT89 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRNP1Q6NT89 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRNP1Q6NT89 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRNP1Q6NT89 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRNP1Q6NT89 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRNP1Q6NT89 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRNP1Q6NT89 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRNP1Q6NT89 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms