Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG16L1Q676U5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG16L1Q676U5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG16L1Q676U5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG16L1Q676U5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG16L1Q676U5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG16L1Q676U5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG16L1Q676U5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG16L1Q676U5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG16L1Q676U5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG16L1Q676U5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG16L1Q676U5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATG16L1Q676U5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATG16L1Q676U5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATG16L1Q676U5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATG16L1Q676U5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATG16L1Q676U5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATG16L1Q676U5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ATG16L1Q676U5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATG16L1Q676U5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATG16L1Q676U5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ATG16L1Q676U5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.52■■□□□ 1.35
ATG16L1Q676U5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATG16L1Q676U5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATG16L1Q676U5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ATG16L1Q676U5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATG16L1Q676U5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATG16L1Q676U5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ATG16L1Q676U5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATG16L1Q676U5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATG16L1Q676U5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG16L1Q676U5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG16L1Q676U5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG16L1Q676U5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG16L1Q676U5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG16L1Q676U5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG16L1Q676U5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG16L1Q676U5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG16L1Q676U5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG16L1Q676U5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG16L1Q676U5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG16L1Q676U5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG16L1Q676U5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG16L1Q676U5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG16L1Q676U5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG16L1Q676U5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG16L1Q676U5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATG16L1Q676U5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATG16L1Q676U5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATG16L1Q676U5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATG16L1Q676U5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG16L1Q676U5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG16L1Q676U5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG16L1Q676U5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATG16L1Q676U5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATG16L1Q676U5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATG16L1Q676U5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATG16L1Q676U5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATG16L1Q676U5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATG16L1Q676U5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATG16L1Q676U5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATG16L1Q676U5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATG16L1Q676U5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATG16L1Q676U5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATG16L1Q676U5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATG16L1Q676U5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATG16L1Q676U5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG16L1Q676U5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG16L1Q676U5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG16L1Q676U5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG16L1Q676U5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG16L1Q676U5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG16L1Q676U5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG16L1Q676U5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG16L1Q676U5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG16L1Q676U5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG16L1Q676U5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG16L1Q676U5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG16L1Q676U5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG16L1Q676U5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG16L1Q676U5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG16L1Q676U5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG16L1Q676U5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG16L1Q676U5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG16L1Q676U5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG16L1Q676U5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG16L1Q676U5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG16L1Q676U5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG16L1Q676U5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG16L1Q676U5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG16L1Q676U5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG16L1Q676U5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG16L1Q676U5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG16L1Q676U5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG16L1Q676U5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG16L1Q676U5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG16L1Q676U5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG16L1Q676U5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG16L1Q676U5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG16L1Q676U5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms