Protein–RNA interactions for Protein: Q659C4

LARP1B, La-related protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1BQ659C4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LARP1BQ659C4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LARP1BQ659C4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LARP1BQ659C4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LARP1BQ659C4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LARP1BQ659C4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
LARP1BQ659C4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LARP1BQ659C4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
LARP1BQ659C4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LARP1BQ659C4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LARP1BQ659C4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LARP1BQ659C4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LARP1BQ659C4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LARP1BQ659C4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
LARP1BQ659C4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LARP1BQ659C4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LARP1BQ659C4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LARP1BQ659C4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LARP1BQ659C4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LARP1BQ659C4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
LARP1BQ659C4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LARP1BQ659C4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LARP1BQ659C4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LARP1BQ659C4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LARP1BQ659C4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LARP1BQ659C4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LARP1BQ659C4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LARP1BQ659C4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LARP1BQ659C4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LARP1BQ659C4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
LARP1BQ659C4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
LARP1BQ659C4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
LARP1BQ659C4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LARP1BQ659C4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LARP1BQ659C4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LARP1BQ659C4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LARP1BQ659C4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LARP1BQ659C4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LARP1BQ659C4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LARP1BQ659C4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LARP1BQ659C4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LARP1BQ659C4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LARP1BQ659C4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LARP1BQ659C4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LARP1BQ659C4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LARP1BQ659C4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LARP1BQ659C4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LARP1BQ659C4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LARP1BQ659C4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LARP1BQ659C4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LARP1BQ659C4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LARP1BQ659C4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LARP1BQ659C4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LARP1BQ659C4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LARP1BQ659C4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
LARP1BQ659C4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LARP1BQ659C4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LARP1BQ659C4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LARP1BQ659C4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LARP1BQ659C4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LARP1BQ659C4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LARP1BQ659C4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
LARP1BQ659C4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LARP1BQ659C4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LARP1BQ659C4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LARP1BQ659C4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LARP1BQ659C4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LARP1BQ659C4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LARP1BQ659C4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LARP1BQ659C4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
LARP1BQ659C4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
LARP1BQ659C4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LARP1BQ659C4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LARP1BQ659C4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LARP1BQ659C4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LARP1BQ659C4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LARP1BQ659C4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LARP1BQ659C4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LARP1BQ659C4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LARP1BQ659C4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LARP1BQ659C4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LARP1BQ659C4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LARP1BQ659C4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LARP1BQ659C4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LARP1BQ659C4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LARP1BQ659C4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LARP1BQ659C4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LARP1BQ659C4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
LARP1BQ659C4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
LARP1BQ659C4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
LARP1BQ659C4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LARP1BQ659C4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LARP1BQ659C4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LARP1BQ659C4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LARP1BQ659C4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LARP1BQ659C4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LARP1BQ659C4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LARP1BQ659C4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LARP1BQ659C4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LARP1BQ659C4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms